磷虾类线粒体基因组的特征和基因排列比较

磷虾类线粒体基因组的特征和基因排列比较

作者：申欣;王海青;王敏晓;刘斌

作者机构：淮海工学院海洋学院,连云港 222005;中国科学院海洋研究所,青岛266071;中国科学院海洋研究所,青岛266071;中国科学院海洋研究所,青岛266071;中国科学院海洋研究所,青岛266071 来源：渔业科学进展 ISSN：1000-7075 年：2012 卷：033 期：002 页码：49-55 页数：7

中图分类：Q915.819+.6 正文语种：chi

关键词：磷虾;长PCR;线粒体基因组;基因重排;分子标记

摘要：利用长PCR扩增获得太平洋磷虾的线粒体DNA,结合鸟枪法和引物步移法测定太平洋磷虾的线粒体基因组.结果表明,太平洋磷虾线粒体基因组全长为16 898 bp,在最大非编码区中存在一个串联重复区域(4.7×154 bp).在15个主编码基因中,变异位点数最多的是nad5基因(319～321个),其次为nad4基因(284～285个)和cox1基因(232～233个).因此,nad5基因和nad4基因可以作为候选的分子标记,用于分析磷虾类不同的物种和群体之间的生物多样性.对比泛甲壳动物的原始排列,太平洋磷虾和南极磷虾线粒体基因组共享3个转运RNA基因(tRNALeu(CUN)、tRNALeu(UUR)和tRNATrp)的易位.与太平洋磷虾线粒体基因组相比,南极磷虾线粒体基因组存在1个转运RNA基因

(tRNAAAsn)的重复和1个转运RNA基因(tRNAlle)的易位.太平洋磷虾和南极

磷虾之间的基因排列并不完全一致,说明在磷虾类内部线粒体基因组的基因排列顺序并不保守.