临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌分子流行病学研究及一例皮特不动杆菌全基因组分析

临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌分子流行病学研究及一例皮

特不动杆菌全基因组分析

目的了解临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌的耐药表型,探究其携带的β-内酰胺酶耐药基因,并对重症监护病房多重耐药鲍曼不动杆菌进行同源性分析,了解其暴发流行趋势。同时对一例皮特不动杆菌进行全基因组分析,了解其特有的基因组学特征。

方法（1）收集临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌并收集其临床一般资料。（2）分析菌株的临床一般资料,如患者的年龄和性别、科室分布及标本来源情况。

（3）使用VITEK-2 COMPACT全自动微生物分析对菌株做初步鉴定,同时利用PCR扩增rRNA基因间隔区（ITS）、recA和bla_OXA-51三个特有基因,对菌株进行再次鉴定。（4）对收集的菌株进行体外药敏实验及碳青霉烯酶抑制实验,了解其耐药表型。

（5）提取细菌DNA,PCR法扩增β-内酰胺酶耐药基因,对电泳阳性的PCR反应体系进行基因片段的测序,并在BLAST网上比对。（6）对其中某ICU病区的28例多重耐药鲍曼不动杆菌进行多位点序列分型（MLST）,并在pubmlst网上比对得到序列型,同时利用eBURST软件分析数据。

（7）对收集的一例皮特不动杆菌进行全基因组测序并行生物信息学分析。结果73例鲍曼不动杆菌中68.5%来自男性患者,且多来源于60岁以上的老年患者。

标本主要来自于ICU病区,且以呼吸系统来源最常见。73例菌株对哌拉西林、头孢类抗生素、亚胺培南、美罗培南、环丙沙星以及哌拉西林/他唑巴坦全部耐药,除了对多粘菌素、替加环素和米诺环素有较高的敏感性外,对其他抗生素均高

度耐药。

所有菌株均携带bla_AmpC基因,且有97.3%携带ISAba1-AmpC基因,获得性耐药基因以bla_TEM和bla_OXA-23最常见,所有菌株均携带这两种基因中的至少一个基因,同时携带此两种基因的菌株达58.9%。本研究检测出一例同时携带bla_KPC、bla_SHV、bla_TEM以及ISAba1-AmpC基因的多重耐药鲍曼不动杆菌。

对ICU病区28例多重耐药鲍曼不动杆菌进行多位点序列分析得到9种序列型（ST）,其中包括四种新的ST型,其中ST1779、ST1789和ST195三种类型为主要感染克隆株,占所有菌株的67.9%,eBURST软件分析得到一个同分型组和两个单体。同时本研究发现一例携带bla_NDM-1、bla_OXA-421和bla_AmpC基因的皮特不动杆菌。

结论本院多重耐药鲍曼不动杆菌耐药性严重,其广泛合成碳青霉烯酶;β-内酰胺酶耐药基因广泛存在于多重耐药鲍曼不动杆菌中,β-内酰胺酶耐药基因的携带与鲍曼不动杆菌对β内酰胺类抗生素耐药有关;ICU病区是鲍曼不动杆菌感染的重要科室,且易出现暴发流行。在这里,我们首次在安徽地区报道了临床分离出的皮特不动杆菌,且该菌株同时携带bla_NDM-1、bla_OXA-421和bla_AmpC三种耐药基因,其中bla_OXA-421基因为首次在中国发现。