基于生物信息学途径评估UBE2家族及UBE2T基因在肺腺
癌中的表达及临床意义
杨豪帅; 赖慧娜; 饶怡茹; 林晓平
【期刊名称】《中山大学学报（医学科学版）》 【年(卷),期】2020(041)003
【摘要】[目的]探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T(UBE2T)在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系.[方法]利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析,对总生存时间(OS;Cox回归检验)、总分期(Kruskal-Wallis H检验)、T分期(Kruskal-Wallis H检验)、N分期(Kruskal-Wallis H检验)及M分期(Wilcox秩和检验)进行差异比较.运用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库获取UBE2T基因在肺腺癌组织和癌旁组织中的表达信息,将结果进行两独立样本t检验.利用GSEA软件进行KEGG通路及富集分析.[结果]UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达量与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系.其中,UBE2T高表达者其OS较短,TNM分期较晚者UBE2T呈高表达,差异均具有统计学意义(P<0.05).UBE2T mRNA表达量在肺腺癌中明显升高(P<0.01).基因富集结果显示高表达的UBE2T与细胞周期(FDR=0),剪接体(FDR=0),DNA修复(FDR=0)及糖代谢等36个信号通路密切相关(FDR<0.05).UBE2家族的UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA均与肺腺癌的临床病理特征存在相关关系,其中UBE2T的表达水平与临床分期及预后的关系最为密切,且与肿瘤细胞糖酵解通路密切相关.[结论]UBE2家族与肺腺癌临床病理特征相关.UBE2T mRNA有望成为肺腺癌新的生物标志物.
【总页数】7页(445-451)
【关键词】肺腺癌; UBE2T; UBE2家族; 基因表达; 数据库; 泛素化; 糖代谢 【作者】杨豪帅; 赖慧娜; 饶怡茹; 林晓平
【作者单位】中山大学 中山医学院 广东广州 510080; 中山大学 肿瘤防治中心核医学科 广东广州510060 【正文语种】中文 【中图分类】R73 【相关文献】
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基于生物信息学途径评估UBE2家族及UBE2T基因在肺腺癌中的表达及临床意义
