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常用试剂培养基 毕赤酵母实验技术

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主要培养基:

10×YNB(13.4%酵母氮源,含硫酸铵不含氨基酸): 溶解13.4gYNB于100mL水中,过滤除菌,加热至YNB完全溶解,存于4℃。 500×B(0.02%生物素):

溶解20mg生物素于100mL 水中,过滤除菌,放于4℃。 100×AA(0.5%各种氨基酸): 溶解各50mg L-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨酸,L-亮氨酸,L-异亮氨酸于100mL

水中,过滤除菌,存于4℃。 10×D(20%葡萄糖):

溶解200g D-葡萄糖于1 000mL水中,高压灭菌15min或过滤除菌,可放1

年。

500×生物素(0.02%):

溶解20mg生物素于100mL水中,过滤除菌,放于4℃,可放1年。 100×H(0.4%组氨酸):

溶解400mg L-组氨酸于100mL水中,低于50 度加热以促溶解,过滤除菌,

可放1年。 10×M(5%甲醇):

混合5mL甲醇与95mL水,过滤除菌存于4℃,可放2个月。 10×GY(10%甘油):

混合100mL甘油与900mL 水,过滤或高压灭菌,室温放置,可存放1年

以上。

100×AA(0.5%各种氨基酸): 溶解各50mg L-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨酸,L-亮氨酸,L-异亮氨酸于100mL

水中,过滤除菌,存于4℃,可放1年。 1mol/L磷酸钾缓冲液 pH6.0:

32mL 1mol/L K2HPO4,868mL 1mol/L KH2PO4,调整pH值为6.0±0.1(如

果需调pH值,用磷酸或KOH)。过滤或高压灭菌,室温下可放1年以上。 100mg/mL遗传霉素:

用无菌水制备30mL 100mg/mL 遗传霉素贮存液,过滤除菌,存于-20℃。

用来制备含不同终浓度遗传霉素平板:0.25,0.5,0.75,1.0,1.5,1.75,2.0,3.0,4.0。 LB培养基:

5%酵母提取物,10%胰蛋白陈,10%NaCI,pH7.0;高压灭菌后4℃保存。 LB平板培养基

在LB液体培养基中加入琼脂粉15g,高压灭菌,冷却至45℃左右时倒平皿,4℃保存。 LA平板培养基

待LB液体培养基冷却至45℃左右加入Amp (100μg/mL),摇匀后倒平皿,4℃保存。

YPD培养基:

1%酵母提取物,2%胰蛋白膝,2%葡萄糖; RDB

转化固体培养基:(Regeneration Dextrose Medium+ Histidine)

( lmol/L山梨醇,l%葡萄糖,1.34% Yeast Nitrogen Base with Ammonium

Sulfate with amino acids(YNB),0.00004%Biotin,0.005%谷氨酸,0.005%甲硫氨酸,0.005%赖氨酸,0.005%亮氨酸,0.005%异亮氨酸,1.5%琼脂;) 100mL:超纯水 80ml,山梨醇 18g(186g/L),琼脂糖2g(20g/L)

121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml,

10*D(20%葡萄糖)10ml, 500*B(0.02%生物素)0.2ml 100*AA(含每种氨基酸0.5%)1ml.混匀,倒平板。 YPD-遗传霉素平板:

1%酵母浸出物,2%蛋白胨,2%葡萄糖,2%不同量的遗传霉素4.0,250mL

(8-10个遗传霉素平板)。取1g G418溶于1ml 1M的HEPES液或PBS中,加蒸馏水至10ml,过滤消毒,4度保存。具体方法如下:1g包装的G418瓶子中,加入10ml HEPES溶液,浓度为100 mg/ml完全溶解后,0.22 um过滤,-20度保存。HEPES缓冲液配方如下:90 ml 水中,0.8 g NaCl, 0.037 g KCl, 0.0135 g Na2HPO4.2H2O, 0.1 g 葡萄糖,0.5 g HEPES,溶解,NaOH调PH至7.05,定容至100ml。

0.50mg/ml,0.75mg/ml,1.0mg/ml,2.0mg/ml,4.0mg/ml五个梯度 MD:

选择培养基:(Minimal Dextrose Medium+ Histidine) (1.34%YNB,0.00004%Biotin,2%葡萄糖,1.5%琼脂;)

100mL: 向80 mL 超纯水中加入琼脂糖2g(20g/L),121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, 10*D(20%葡萄糖)10ml, 500*B(0.02%生物素)0.2ml,混匀,倒平板。 MM:

选择培养基:(Minimal Methanol+ Histidine )(1.34%YNB,0.00004%Biotin,0.05%甲醇,1.5%琼脂;)

100mL:向90 mL 超纯水中加入琼脂糖2g(20g/L),121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 10ml, , 500*B(0.02%生物素)0.2ml,5mL甲醇混匀,倒平板。 BMGY:

诱导表达培养基 (Buffer Glycerol-complex Medium) ( 1%酵母提取物,2%蛋白陈,100mmol/L磷酸缓冲液(pH6.0),1.34% YNB,0.00004% Biotin,l%甘油(V/V);) 1L:酵母提取物10g/L,蛋白胨 20g/L,K2HPO4 3g/L, KH2PO4 11.8G/L,超纯水 890Ml,121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 100ml, 500*B(0.02%生物素)1ml,甘油10mL。 BMMY:

诱导表达培养基 (Buffer Methanol-complex Medium) 除以0.5%甲醇代替甘油,其余成分与BMGY相同。

1L:酵母提取物 10g/L, 蛋白胨 20g/L, K2HPO4 3g/L, KH2PO4 11.8G/L,超纯水 895Ml,121℃灭菌20分钟,待温度将至60℃以后,在超净台内加入10*YNB 100ml,500*B(0.02%生物素)1ml,5mL甲醇。

主要溶液

2*SDS样品缓冲液:

25mL 4*Tris?HCl,PH6.8(0.lmol/L) 20mL甘油[20%(w/v)] 4g SDS[4%(w/v)] 2mL2-巯基乙醇或3.1g DTT 1mg溴酚兰[0.001%(w/v)]

加蒸馏水至l00mL并混匀,等量分装成lmL于-70℃贮存。 5*SDS电泳缓冲液:

15.lgTris碱(0.125mol/L) 72.0g甘氨酸(0.96mol/L) 5.0g SDS[0.5%(w/v)] 使用前稀释至1XSDS电泳缓冲液,贮存液不必调教pH值,稀释后溶液pH8.3,

使用前于0-4℃保存。

考马斯亮兰染色 固定液:

50%(v/v)甲醇 10%(v/v)乙酸 40%重蒸水 染色液:

50%(v/v)甲醇 0.05%(v/v)考马斯亮兰R-250 40%重蒸水 10%(v/v)乙酸

配制时先用甲醇溶解考马斯亮兰,再加入乙酸和水。溶液可保存6个月,

若出现沉淀,滤除即可。 脱色液:

7%(v/v)乙酸 5%(v/v)甲醇 88%重蒸水

一、大肠制备感受态细胞 需灭菌的设备 大离心管:

小离心管:50ml 大枪头5ml LB培养基: 10%甘油

1 挑单个大肠接入LB液体培养基,培养过夜37℃摇床,并做抗性对照。 2以1:100比例接菌,进行大摇(2ml接入200ml 培养基中37℃摇床)

3OD达到0.5-0.7时,冰上放置20min。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余

4加入等体积的10%甘油轻轻重悬。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余 5加入1/2体积的10%甘油轻轻重悬。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余

6加入1/4体积的10%甘油轻轻重悬。4℃离心,4000g,15min.弃上清,不溜残余

7加入适量灭菌10%甘油,一般500ml菌液加入2ml甘油,重悬, 8分装,每管40ul,先冻与液氮,然后放入-80℃保存

二、毕赤酵母GS115电转化感受态的制备

1.在含5mLYPD的50mL 离心管中,培养P. pastoris,30℃过夜; 2.取0.1-0.5mL过夜培养物,接种含50mL新鲜培养基的摇瓶,过夜生长至OD600=1.3-1.5;

3.在4 ℃,1 500 r/min离心5min收集细胞,用5mL预冷的灭菌水悬浮细胞; 4.如上离心,用5 mL预冷的灭菌水悬浮细胞;

5.如上离心,用2mL预冷的1mol/L山梨醇悬浮细胞;

6.如上离心,用1 mL 预冷的1mol/L山梨醇悬浮细胞,至终体积约1.5mL(可冻存80μL等量的电感受态细胞,但转化效率会下降很多)。

三、毕赤酵母电转化

1.取80μL上述细胞与5-10μL经S线性化DNA(约5-20ug)混合,转入预冷的0.2cm 电转杯中; 2.在冰上放置5min;

3.根据所使用装置推荐的S. cerivisiae参数进行电击(1 500V,5ms); 4.立即加入1mL 预冷的1mol/L山梨醇至杯中,将内容物转移至灭菌离心管中; 5.分成200-600μL等份,涂于RDB平板上,进行His营养缺陷筛选; 6.在30℃孵育平板3-5d,至His+克隆产生。

四.G418筛选多拷贝基因

1)取出长有克隆的3块板,可考虑先挑10-20个菌落先表达;

2)第一块加入2ml 灭菌的ddH2o,用涂布棒打匀,洗后,菌液吸入第二块; 3)第二块加入1ml,洗之,吸入第三块; 4)菌液吸入EP管,可适量补充ddH2o;

5)混匀后取适量稀释约50倍,4ul×50=200ul每块G418板,G418浓度从0.25-4.0mg/ml各一块;

6)注意涂布均匀,可适量补充ddH2o,

7)300C烘箱培养,2-5day,其余菌液可40C保存 注:

a)手册推荐方法:第4)步将菌液转入EP管中,振荡5-10秒,用分光光度计

测菌体密度,1OD600=5×107 cells/ml, 取一定体积稀释至200ul/每块G418板, 涂布~105 cells;注意agar的存在会干扰分光光度计的读数。

五.表达:

1)从G418板挑单克隆入4ml/管MGY接种,300C,250rpm,2天左右至OD=2-6,颜色乳白; 2)取1ml菌液于EP管中保种,余3ml菌液离心,1500g,5min,菌体换3ml BMMY,加千分之五甲醇,300ul/管;

3)每隔24小时加千分之五甲醇;

4)至表达之日起2天后每天取样80ul,留作电泳分析;

5)表达4天结束,1500g离心,5min,分别收集上清和沉淀;

6)上清用作蛋白分析,跑SDS-PAGE电泳,Western Blotting分析,ELISA分析,样品浓缩,纯化分析等

六.质粒提取(碱裂解) (1)溶液I:50 mmol/L葡萄糖,25 mmol/L Tris-HCl(pH8.0),10 mmol/L EDTA (pH8.0), 配制200ml。

取葡萄糖(C6H12O6.H2O)1.982 g,双蒸去离子水160 ml,0.5 mol/L EDTA 4ml,1 mol/L Tris-HCl(pH8.0) 5 ml,定容至200 ml,高压灭菌后4℃保存。 (2)溶液II:0.2 mol/L NaOH, 1%SDS。 配制100 ml,现用现配。

10 mol/L NaOH 2 ml,双蒸去离子水80 ml,10%SDS 10 ml,最后用双蒸去离子水定容至100 ml,室温保存。 (3)溶液III:配制100 ml。

5 mol/L 乙酸钾 60 ml,冰乙酸11.5 ml,双蒸去离子水28.5 ml。 (4)5 mol/L 乙酸钾(200 ml)

乙酸钾98.14 g,溶解于160 ml双蒸去离子水中,搅拌溶解后定容至200 ml。 (5)3 mol/L 乙酸钠(NaAc)(pH5.2)

取乙酸钠(CH3COONa.3H2O) 204.1g,溶解于200 ml双蒸去离子水中,用冰乙酸调pH5.2,双蒸去离子水定容至500 ml,高压灭菌后4℃保存。 (6)10 mol/L NaOH溶液(100 ml) NaOH晶体40 g,加水至100 ml。

(7)10%SDS

称取SDS 10g,溶解于80 ml水中,68℃助溶,加数滴1 mol/L HCl调pH7.2,定容至100 ml。

(8)0.5 mol/L EDTA(pH8.0) (100 ml)。 Na2EDTA.2H2O 18.61 g, H2O 70 ml,边搅拌边加入NaOH固体调节pH,接近pH8.0时才充分溶解,大约需NaOH 2g。最后加水至100 ml。 2、质粒的提取

(1)吸取1.5毫升菌液至1.5 ml Eppendorf离心管中,3 000 rpm离心3分钟,弃上清液。

(2)加上1.5毫升菌液,重复操作(1)。

(3)用移液器尽可能除去上清液,加入预冷150微升溶液I,震荡。

(4)加入200微升溶液Ⅱ,缓慢地上下翻转离心管约10次,勿震,混合均匀。室温下放置5分钟。 (5)加入150微升溶液Ⅲ,上下翻转离心管约10次,混合均匀,冰浴10分钟。4℃,12,000 rpm离心5分钟。

(6)用移液器将上清液转移到新的1.5 ml Eppendorf离心管中,加入1倍体积(400微升)异丙醇抽提,12 000 rpm离心5分钟。

(7)弃上清,加入1ml70%乙醇洗涤沉淀一次,离心5-10min (8)弃上清,烘干10min。 (9)加20微升TE缓冲液(含20ul/ml RNase)溶解DNA沉淀,37℃半小时,-20℃保存。

实验流程:

1. pPIC9K+pulluGene(histag)——GS115(His缺陷筛)——G418筛——

GS115-Pullu——酶活性鉴定

2. pulluGene分析——选择tRNA Genes——设计引物以GS115基因组为模板

PCR——tRNA Genes

3. pFLDa+ tRNA Genes——GS115-Pullu(zeocin筛)——GS115-Pullu-plus——酶

活鉴定——表达量比较

常用试剂培养基 毕赤酵母实验技术

主要培养基:10×YNB(13.4%酵母氮源,含硫酸铵不含氨基酸):溶解13.4gYNB于100mL水中,过滤除菌,加热至YNB完全溶解,存于4℃。500×B(0.02%生物素):溶解20mg生物素于100mL水中,过滤除菌,放于4℃。100×AA(0.5%各种氨基酸):溶解各50mgL-谷氨酸,L-蛋氨酸,L-赖氨
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