全自动核酸提取仪对三种性传播病原体检测的性能评价*
张 睿,叶阿里,孔令君,窦亚玲,伊 洁
【摘 要】目的 评价全自动核酸(RNA)提取仪(型号MagX)对沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis,CT)、淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae,NG)和解脲脲原体(Ureaplasmaurealyticum,UU)检测结果应用于临床的可行性。方法 收集检测CT样本159例、NG样本128例、UU样本144例,应用荧光核酸恒温扩增检测技术(Simultaneous Amplification and Testing,SAT),同一样本分别采用手工提取分装加样和MagX提取分装加样两种检测方法,然后进行实时荧光PCR。以手工检测结果为金标准,对MagX检测结果进行阳性符合率(灵敏度)、阴性符合率(特异度)、总符合率(准确度)的评价。同时,对该仪器进行防污染验证。全自动核酸(RNA)提取仪与手工检测结果进行Kappa一致性分析。结果 159例CT,128例NG和144例UU样本的阳性符合率、阴性符合率、总符合率依次为CT:0.910 6,92.59%,98.48%和97.48%;NG:0.938 3,100.00%,98.18%和98.44%;UU:0.885 6,93.33%,95.24%和94.44%;其Kappa系数均>0.8(CT:Kappa=0.910 6,NG:Kappa=0.938 3,UU:Kappa=0.885 6),CV值均<5%;没有携带污染现象存在。结论 上海仁度生物科技生产的CT,NG和UU核酸检测试剂盒(RNA恒温扩增)在全自动核酸(RNA)提取仪(型号MagX)的检测符合临床检测标准,可在临床使用。
【期刊名称】现代检验医学杂志 【年(卷),期】2017(032)006 【总页数】3
【关键词】沙眼衣原体;淋病奈瑟菌;解脲脲原体;全自动核酸(RNA)提取仪 性传播微生物,沙眼衣原体(chlamydia trachomatis,CT)、淋病奈瑟菌(neisseria gonorrhoeae,NG)、解脲脲原体(ureaplasma urealyticum,UU)[1]可导致淋病、非淋球菌性尿道炎、宫颈炎、宫颈糜烂、女性不孕和男性免疫性不育[2,3]等,是人类泌尿生殖道的常见病原体,也是性传播疾病(sexually transmitted diseases,STD)的主要病原[4,5]。目前检测其方法基本都以手工法为主。
本研究旨在验证全自动核酸(RNA)提取仪(型号MagX)对CT,NG和UU检测的适用性和准确度以及临床应用的可行性。
1 材料与方法
1.1 研究对象 收集2015年9~10月北京协和医院就诊的CT,NG和UU疑似感染者和正常体检者的检测样本,CT样本159例、 NG样本128例、UU样本144例。样本类型为尿液和拭子,-20℃保存。
1.2 试剂和仪器 CT,NG,UU核酸检测试剂盒(RNA恒温扩增) (上海仁度生物科技有限公司),磁珠、扩增检测液、磁力架、吸引器、全自动核酸(RNA)提取仪(型号MagX);采用RocheLight Cycler480Ⅱ(美国)主机扩增以及Light Cycler?480 Software release 1.5.0 SP4软件进行数据分析。
1.3 操作步骤 严格按照试剂说明书,采用手工磁珠提取法对样本进行核酸提取,并手工加入PCR反应试剂和提取的核酸模板于96孔板上;同一样本同步在MagX上进行,具体操作步骤如下:先将样本放入样本架上,放好提取试剂,PCR扩增试剂,按相应位置放置吸头、六连排反应管和PCR扩增反应管,按仪器指令在电脑屏幕确认后开始进行实验。仪器通过条形码识别每份样本,采
用磁珠法自动提取核酸、配制PCR反应体系并加样到PCR反应管孔中。最后,将手工和MagX加好的PCR反应管放入Roche Light Cycler480Ⅱ,用相同的PCR程序进行扩增反应。MagX可以将记忆的样本信息,如样本架位置、条形码信息(患者姓名、条码号、检测项目)等传送给PCR仪,确保样本放置的顺序和PCR仪顺序一致,避免人为操作失误。手工检测需将信息手工录入。最后,将手工和MagX检测的数据输入到Excel表中,分别统计两种方法的阴性、阳性个数。
1.4 MagX精密度评估 将同一批次三种阳性质控品在10天内重复进行20次实验,通过循环阈值(Cycle threshold,Ct)计算CV%。
1.5 评估MagX携带污染 在样本架上,将高浓度阳性质控品与阴性样本(0.9 g/dl生理盐水)以相邻的放置方式循环放置,测试其携带污染情况,验证仪器的防污染能力。5次防污染验证标准:阳性均需检出,阴性不得检出阳性。 1.6 质量控制 测定过程中所有操作均严格按照实验室室内质量控制文件进行。试验过程中,同时测定试剂盒自带的阴性、阳性质控。如果当天质控在控,则纳入当天测定数据,若质控失控,需重新测试。同时原始记录保持完整,以确保实验数据准确性和可溯源性。
1.7 统计学分析 采用Excel 2007及SPSS17.0统计软件,进行Kappa一致性分析和四格表分析。Kappa系数≥0.8,为高度一致,认为两种方法检测结果等效;0.4≤Kappa系数<0.8认为一致,需进行阳性符合率和阴性符合率比较;Kappa系数<0.4则认为两种方法检测结果不一致,两系统不等效。
2 结果
2.1 MagX与手工检测结果比较 见表1~3。CT检测样本159例,Kappa系数