多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳在肠炎沙门菌分子分型的比较

多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳在肠炎沙门菌分子分型

的比较

计融;李燕俊;王玉平;崔生辉;江涛

【期刊名称】《中华流行病学杂志》 【年(卷),期】2006(027)012

【摘要】目的 比较多位点序列分型技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术在肠炎沙门菌菌株间分型的分辨率.方法 分别建立肠炎沙门菌的6个管家基因thrA、purE、sucA、aroC、hemD、dnaN和一个特异性的DNA标记SdfⅠ的多位点序列分型技术,及以寡切点的Xba Ⅰ、SpeⅠ作为限制性内切酶的PFGE方法,并应用上述方法对食品中的分离株进行分型,比较两种方法的分辨率.结果 PFGE可以将50株肠炎沙门菌分为11个型,并且通过双酶系统的双重PFGE分型,还可以将PFGE型别再精细划分为亚型;MLST则揭示了在同一血清型内部,各菌株之间的管家基因碱基序列高度保守,而在沙门菌不同血清型的核苷酸序列之间,则分别存在不同数量的碱基差异.即MLST方法只能用于血清型之间,不能在血清型内部进行分型研究.结论 与MLST比较,PFGE方法在肠炎沙门菌的分型方面显示了比较高的分辨率. 【总页数】4页(1065-1068)

【关键词】肠炎沙门菌;多位点序列分型;脉冲场凝胶电泳;分辨率 【作者】计融;李燕俊;王玉平;崔生辉;江涛

【作者单位】100021,北京,中国疾病预防控制中心营养与食品安全所;100021,北京,中国疾病预防控制中心营养与食品安全所;100021,北京,中国疾病预防控制中心营养与食品安全所;100021,北京,中国疾病预防控制中心营养与食品安全

所;100021,北京,中国疾病预防控制中心营养与食品安全所 【正文语种】中文 【中图分类】R5 【相关文献】

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