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DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用

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DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用

唐刘秀 1,2,许志强 1,葛家春 1,2,3

【摘 要】摘 要:简单介绍了DNA分子标记技术,阐述了DNA分子标记技术在水产动物遗传多样性分析、种质鉴定、亲缘关系研究、亲子鉴定、遗传图谱构建、QTL定位和分子标记辅助育种等方面的研究应用成果,期望该技术在水产动物遗传育种研究中开辟新途径。 【期刊名称】水产养殖 【年(卷),期】2013(034)010 【总页数】5

【关键词】关键词:DNA标记;水产动物;遗传;育种

品种是养殖业的物质基础,培育高效、优质和抗病力强的品种是当前水产养殖业增产的有效途径。传统的新品种培育方法主要是选择育种,利用选择育种的方法已经培育成许多水产动物新品种,如荷包红鲤(Cyprinus carpio var.Wuyuanensis)、彭泽鲫(Carassius auratus var.Pengzesis)、德国镜鲤(Cyprinus carpio L.)选育系等。传统育种方法在推动世界水产养殖业的发展方面发挥了非常重要的作用,但超长的育种周期严重制约了育种业的快速发展。 近年来,随着现代生物技术的不断发展,细胞生物学、分子生物学等新兴生物技术开始被不断地运用到水产育种工作中,为水产种业发展注入了新的活力。其中,以新兴发展起来的DNA分子标记技术最引人注目,DNA分子标记的出现使基于此类标记的选择育种技术有了实现的可行性,为水产动物的遗传育种研究开辟了新的途径,显现出了巨大的应用潜力。当前,DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用主要体现在遗传多样性分析、种质鉴定、亲缘关系

研究、亲子鉴定、遗传图谱构建、QTL定位和分子标记辅助育种等方面。

1 DNA分子标记技术

DNA分子标记技术是以基因组DNA的多态性为基础的一种新型遗传标记技术,它可以直接反映生物个体在DNA水平上的差异。与传统的遗传标记相比,DNA分子标记具有标记位点多、遗传信息量大、实验重复性强、不受生物的年龄、发育阶段、性别和养殖环境条件的影响等特性,因此倍受遗传学家和育种学家的青睐,已被广泛地应用于生物的基因定位、基因克隆、遗传育种等诸多方面,并成为分子生物学与分子遗传学研究的主要内容之一。如今,应用于遗传育种领域的DNA分子标记技术主要有:随机扩增多态性DNA(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)、限制性片段长度多态性技 术 (Restriction fragment length polymorphism,RFLP)、扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)、简单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)、单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNPs)、表达序列标签(expressed Sequence tags,ESTs)、单链构象多态性(single strand conformation polymorphism,SSCP)、特异序列扩增(sequence characterized amplified regions,SCAR)、线粒体 DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)分子标记、可变串联重复序列(Variable Number of Tandem Repeats,VNTR)、核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)分子标记等。

2 DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用

2.1 水产动物遗传多样性分析

遗传多样性是指种内或种间表现在个体、细胞、分子3个水平的遗传变异程度,

具体表现在形态特征、核型特征以及DNA分子水平的多态性。获得物种的遗传多样性和遗传结构信息不仅对物种的遗传变异与系统地位的研究具有重要意义,而且可以为物种的分类和改良提供重要资料。分子标记是基于DNA差异进行个体或群体遗传多样性分析的有力工具。常用于水产动物遗传多样性分析的分子标记有RAPD、AFLP和SSR等。

孙景春等[1]利用40个随机引物对荷包红鲤、玻璃红鲤(Cyprinus carpio var.Wananensis)和兴国红鲤(Cyprinus carpio var.Xingguonensis)及野鲤(俗称“江西三红”)进行了RAPD检测及聚类分析。结果表明:三个品种内,以荷包红鲤的遗传距离最小;对于品种间,则是玻璃红鲤与兴国红鲤较为相似,“江西三红”之间的遗传差异较小。杨淞等[2]运用AFLP分子标记技术检测了橙色莫桑比克罗非鱼(Oreochromis mossambicus)和荷那龙罗非鱼(Oreochromis hornorum)的种群遗传多样性。2个罗非鱼种群均具有较高的遗传多样性,橙色莫桑比克罗非鱼种群内遗传多样性相对更高些,2种罗非鱼的种间遗传距离为0.279,推测该杂交组合可能具有杂种优势。McConnel[3]对加拿大东海5个大西洋鲑(Salmo salar)群体的遗传多样性进行了微卫星分析。鲁双庆等[4]采用微卫星技术,用9对微卫星引物对4个鲫鱼群体普通鲫鱼、红鲫(C.auratus red var)、白鲫(C.auratus cuvieri)和彭泽鲫(C.auratus auratus var.Pengze)的遗传多样性进行研究。结果表明,4个鲫鱼群体的遗传多样性总体水平较高,但白鲫的遗传多样性最高,鲫鱼的遗传多样性最低。 2.2 水产动物种质鉴定

种质鉴定在水产动物育种过程中具有非常重要的意义,鉴定出优良遗传变异的个体可以明显地缩短育种年限,从而使育种工作得以高效的进行。水产动物种

DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用

DNA分子标记技术在水产动物遗传育种中的应用唐刘秀1,2,许志强1,葛家春1,2,3【摘要】摘要:简单介绍了DNA分子标记技术,阐述了DNA分子标记技术在水产动物遗传多样性分析、种质鉴定、亲缘关系研究、亲子鉴定、遗传图谱构建、QTL定位和分子标记辅助育种等方面的研究应用成果,期望该技术在水产动物遗传育种研究中开辟新途径。
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