MACF1的生物信息学分析及细胞定位
骞爱荣;张博;胡丽芳;张维;瓮媛媛;高翔;商澎
【期刊名称】《第四军医大学学报》 【年(卷),期】2009(030)001
【摘要】目的:了解微管微丝交联因子1(MACF1)的结构与功能.方法:采用生物信息学软件对MACF1结构、功能及亚细胞定位进行分析,并利用分子模拟软件对MACF1空间结构进行了模拟,同时采用免疫荧光显微术及共聚焦激光扫描显微术(CLSM)对生物信息学分析的部分结果进行了验证.结果:MACF1由5430氨基酸组成,Mr约为620×103,主要定位于胞质及细胞骨架.MACF1结构中包含1个ABD、37个血影蛋白重复单元、1个SH3结构域、2个EF手臂钙结合位点结构域、1个生长捕获特异蛋白2结构域等基序.并包含4个序列谱及5个序列模式.MACFI的德温特入藏号为Q9UPN3,MACF1包括4个亚型即MACF 1/2/3/5,主要功能可能是将微丝、微管与其它骨架蛋白交联.同源模建结果表明.MACFI与月α-辅肌动蛋白的ABD结构域一级序列的同源性为50.2%.免疫荧光显微术及CLSM结果表明,MACF1主要分布与细胞质,且与微丝、微管骨架部分共定位.结论:MACFI是一种大分子量的骨架交联蛋白,主要定位于细胞质,且与微丝、微管骨架部分共定位,MACF1结构功能可能与α辅肌动蛋白有一定的相似性.
【总页数】4页(33-36)
【关键词】微管微丝交联因子1;生物信息学;结构预测;同源模建 【作者】骞爱荣;张博;胡丽芳;张维;瓮媛媛;高翔;商澎
【作者单位】西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实
验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072;西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072;西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072;西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072;西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072;西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072;西北工业大学生命科学院,空间生物实验模拟技术国防重点学科实验室,特殊环境生物物理学研究所,陕西,西安,710072 【正文语种】中文 【中图分类】Q6-3 【相关文献】
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