凡纳滨对虾Arf6基因的克隆及表达分析

凡纳滨对虾Arf6基因的克隆及表达分析

作者：崔亮;殷勤;陈晓汉;彭金霞;王志伟;李奎

作者机构：广西大学,南宁530021;广西壮族自治区水产研究所,南宁530021;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;广西壮族自治区水产研究所,南宁530021;广西壮族自治区水产研究所,南宁530021;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193 来源：渔业科学进展 ISSN：1000-7075 年：2011 卷：032 期：002 页码：60-65 页数：6

中图分类：Q785;Q786 正文语种：chi

关键词：凡纳滨对虾;RT-PCR;基因克隆;Arf6

摘要：通过电子克隆所得序列设计引物,采用PCR扩增方法首次克隆得到长695bp的凡纳滨对虾Arf6基因序列,其中包括96bp的5'非翻译区

(Untranslated region,UTR)、71bp的3'非翻译区和528bp的开放阅读框.编码175个氨基酸残基,推算分子量约为20kDa,理论等电点为8.82,分子式为C896H1426N252O255S8.氨基酸序列分析表明,Arf6基因编码的氨基酸序列中具有保守的GTP结合区域,总的带负电荷的残基(Asp+Glu)为21,总的带正电荷的残基(Arg+Lys)为25.与其他物种的Arf6基因进行同源比对发现,该基因的氨基酸序列具有较高的保守性,基于氨基酸序列的聚类分析表明,凡纳滨对虾与果蝇属种类亲缘关系最近.半定量RT-PCR的结果显示,该基因在组织中广泛表达且在肝胰腺中表达量最高,在眼柄中表达最低;其在经桃拉综合征病毒(TSV)感染后的