教你如何做好PCR产物污染预防
一、规范行为
建立PCR实验SOP,规范实验人员行
实验员严格遵守操作流程,在操作上最大程度地降低人为因素可能导致的PCR污染或杜绝污染的出现。另外实验员应当具备相应的专业知识和技能,包括熟练操作相关设备、明确整个工作流程、掌握出现污染情况的处理方法和实验室质量控制方法,以及能够正确解释检测结果。
二:规范实验室 建立标准的PCR实验室。
PCR实验室原则上分为四个区域,即试剂准备区、样品处理区、扩增区、扩增产物分析区,前两区为扩增前区,后两区为扩增后区。扩增前区与扩增后区应严格分开。实验材料、试剂、记录纸、笔、清洁材料等,只能从扩增前区流向扩增后区,即从试剂准备区→样品处理区→扩增区→扩增产物分析区,不得逆向流动。实验室的气流也应从扩增前区流向扩增后区,不得逆向流动。理想的PCR实验室设计如下图:
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图A和图B所给出的PCR实验室设置图应是较为理想的设置模式,有条件的实验室可参照此种模式设计。对于一般的普通实验室,建议PCR扩增区和产物分析区能够分隔开,在样本制备区和PCR扩增区尽可能地减少开盖操作。切记:产物分析区的产物及实验用品严禁拿到样本制备区和PCR扩增区。
三:减少实验步骤
如果实验室只是进行PCR检测鉴定,建议使用荧光定量PCR取代常规PCR。
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荧光定量PCR检测结果可以通过荧光信号采集分析,因此反应结束后不需要开盖电泳,避免了反应产物泄露形成气溶胶而造成的PCR产物污染。如果进行凝胶电泳上样步骤时增加开盖次数,易产生气溶胶污染。建议推进定量PCR的应用,并逐步替代定性PCR。
四:采用UNG防污染体系
采用UNG防PCR产物污染体系进行PCR反应。
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体系采用dUTP取代dTTP,PCR反应之后,所有的PCR产物(DNA 片段)均掺有了dUTP;在下一轮PCR反应时,体系中添加的UNG酶,在PCR前37°C孵育5min,能特异的降解所有含有dUTP的DNA片段,之后再进行PCR反应。这样能完全去除由PCR产物引起的气溶胶污染。效果见下图:
注:直接PCR系列可以选用福际生物的防PCR产物污染体系系列产品 建议
对于大规模进行基因分型检测的实验室,强烈推荐在建设合理的实验室之外,检测试剂使用UNG防PCR产物污染体系。
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