白檀SRAP-PCR体系优化及引物筛选
安佰义;于慧颖;吴双;刘晓嘉;孙晓刚;张艳
【期刊名称】《北方园艺》 【年(卷),期】2018(000)024
【摘要】以白檀新生嫩叶为试材,通过单因素试验与正交实验,建立并优化白檀SRAP-PCR反应体系,对白檀SRAP反应体系中5个因素进行优化试验,并筛选SRAP引物组合,以期为今后SRAP分子标记在白檀上的应用提供依据.结果表明:各因素对SRAP-PCR扩增结果影响差异较大,依次为模板DNA＞dNTPs＞Mg2+＞引物＞Taq DNA聚合酶.最优反应体系为总体系10 μL体系中,Taq DNA聚合酶0.75U、dNTPs 0.1 mmol·L-1、Mg2+2 mmol·L-1、引物0.4 μmol·L-1以及模板DNA 80 ng.利用稳定的SRAP-PCR体系,从176对引物组合中筛选出25对多态性好的引物组合.在所建立的最优体系下,不同白檀基因组和不同引物组合均能稳定扩增,表明体系稳定可靠适用于白檀SRAP分子标记研究.
【总页数】6页(15-20)
【关键词】白檀;SRAP;体系优化;引物筛选 【作者】安佰义;于慧颖;吴双;刘晓嘉;孙晓刚;张艳
【作者单位】吉林农业大学 园艺学院,吉林长春130118;吉林农业大学 园艺学院,吉林长春130118;吉林农业大学 园艺学院,吉林长春130118;吉林农业大学 园艺学院,吉林长春130118;吉林农业大学 园艺学院,吉林长春130118;吉林省农业科学院 农业生物技术研究所,吉林长春130124 【正文语种】中文
【中图分类】S792.99 【相关文献】
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白檀SRAP-PCR体系优化及引物筛选
