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酵母信号肽检测结果展示

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目录

1 材料与方法.....................................................................................................................................1

1.1菌株的保存与培养...............................................................................................................1 1.2 培养基的配制 ......................................................................................................................1 1.3 质粒转化酵母 ......................................................................................................................2 1.4 对二糖利用能力 ..................................................................................................................3 1.5 TTC显色 ..............................................................................................................................3

2 结果与分析.....................................................................................................................................3

2.1 对二糖利用能力 ..................................................................................................................3 2.2 TTC显色 ..............................................................................................................................4 附录.....................................................................................................................................................5

1.材料与方法

1.1 菌株的保存与培养 1.1.1 实验用酵母菌株

实验中所用到的YTK12酵母菌株由本公司保存,菌株于YPDA培养液摇菌后保存成30%

的甘油菌于-80℃冷冻保存。YTK12于28℃培养箱中培养。 1.2 培养基的配制

YPDA 酵母提取物 蛋白胨 葡萄糖

10 g/L 20 g/L 20 g/L 0.03 g/L

硫酸腺嘌呤

加水溶解,定容至1 L,固体培养基加入20 g/L琼脂,121℃灭菌15 min。 2×YPDA 酵母提取物 蛋白胨 葡萄糖

20 g/L 40 g/L 40 g/L 0.03 g/L

硫酸腺嘌呤

加水溶解,定容至1 L,固体培养基加入20 g/L琼脂,121℃灭菌15 min。 CMD-W 酵母氮源

6.7 g/L 0.75 g/L 20 g/L 1 g/L

-Trp Dropout 蔗糖

葡萄糖

加水溶解,调节pH至5.8,定容至1 L,固体培养基加入20 g/L琼脂,121℃灭菌15 min。 YPRAA 酵母提取物 蛋白胨

10 g/L 20 g/L

1

棉子糖 20 g/L

加水溶解,调节pH至5.8,定容至1 L,固体培养基加入20 g/L琼脂,121℃灭菌15 min。培养基温度降至50-60℃,超净台内加入2 mL Antimycin A(1 mg/mL)混匀,倒板备用。 1.3 质粒转化酵母

按下表将以下质粒转入酵母YTK12菌株中:

表1 所需转化的质粒

Reaction 1 2 3

plasmid pSUC2 pSUC2-52-JJP pSUC2-Avr1b

涂板种类 SD-Trp SD-Trp SD-Trp

备注 阴性对照 实验组 阳性对照

1) 从YPDA平板挑取YTK12单菌落接种于YPDA液体培养基4 ml,30℃,225 rpm,振荡培养18-20 h(过夜),至OD600>1.5;

2) 转接YPDA液体培养基,培养体积为50 ml,使初始OD600=0.2,30℃,225 rpm,振荡培养4-5 h,至OD600=0.6;

3) 离心收菌,室温,4000 rpm,5 min;

4) 用20 mL无菌水重悬菌体,混匀,离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清; 5) 用5 mL 0.1 M LiAc重悬菌体,混匀,离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清; 6) 用500 μL 0.1 M LiAc重悬菌体,混匀,分装至1.5 mL离心管,每个50 μL(每个转化),备用;

7) 每个1.5 mL离心管中依次加入如下试剂,用枪头吹打混匀,或剧烈振荡1 min左右,至完全混匀;

表2 酵母转化体系各组分及用量

50%PEG3350

240 μL

1 M LiAc 36 μL

ssDNA (20 mg/ml)

5 μL

质粒 各5 μL

8) 30℃水浴孵育,30 min;

2

9) 42℃水浴热激,25 min。

10) 离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清;

11) 加入3 mL 2×YPDA,尽量温和地悬浮菌体,30℃,225 rpm,振荡培养1 h; 12) 离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清;

13) 每个转化用200 μL无菌水悬浮菌体,尽量温和地混匀,涂布CMD-W筛选平板。 1.4 对二糖利用能力

1) 上述平板中,分别随机挑取6个克隆,用SUC2-F/R引物进行PCR验证,全部为正确克隆;

2) 从中选择1个克隆划线到YPRAA平板上,通过观察酵母菌对棉子糖的利用情况来验证信号肽的功能;

3) 同时,将转化子划线到CMD-W平板上作为对照。 1.5 TTC显色

1) 从CMD-W平板挑取单菌种接于液体CMD-W培养基5 mL,30℃,225 rpm,振荡培养24 h;

2) 室温,13000 rpm离心5 min收集菌体;

3) 弃上清,加入1 mL无菌水重悬沉淀,室温,13000 rpm离心5 min收集菌体; 4) 重复步骤3一次;

5) 加入1 mL蔗糖溶液,重悬菌体;

6) 加入1%TTC溶液,35℃水浴30 min,室温放置5 min,观察颜色变化并拍照。

2.结果与分析

2.1 对二糖利用能力

本研究采用pSUC2酵母分泌系统来进行验证,Avr1b的信号肽已经被证明具有分泌功能,

将其信号肽融合至pSUC2的N端,构建pSUC2-Avr1b重组载体作为阳性对照,pSUC2空载体作为阴性对照。另外分别构建pSUC2-X信号肽重组载体,转入酵母菌株YTK12。实验结果表明,阴性对照pSUC2在YPRAA平板上不能生长,而转入pSUC2-X信号肽的酵母可以在YPRAA培养基上生长,结果与阳性对照pSUC2-Avr1b一致,说明该基因的信号肽具有分泌功能(图1)。

3

图1 对二糖利用能力

实验组pSUC2-X信号肽、阴性对照pSUC2与YTK12菌株、阳性对照pSUC2-Avr1b在CMD-W和YPRAA平板上的生长情况。

2.2 TTC显色

由图2可知,携带pSUC2-X信号肽和pSUC2-Avr1b的酵母菌株YTK12分泌蔗糖酶能把

蔗糖水解成单糖,单糖与TTC反应产生红色不溶于水的氯化三苯基四氮唑。YTK12和携带pSUC2的酵母菌株YTK12不分泌蔗糖酶,因此不能与TTC发生显色反应。

图2 TTC显色

实验组pSUC2-X信号肽、阴性对照pSUC2与YTK12菌株、阳性对照pSUC2-Avr1b TTC显色情况。

4

附录

表1 本实验所用的引物 引物名称 SUC2-F SUC2-R 序列(5’-3’) CGTCATTGTTCTCGTTCCCT GTGAAGTGGACCAAAGGTCT 应用 菌落PCR 菌落PCR

5

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目录1材料与方法.....................................................................................................................................11.1菌株
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