生物信息学实验指导实验二ensemble使用 - 图文

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50559478 CGGAATCCCAGGCCGGCTGGGGACCGGTGCACTTGGGCTCCGCGCCCCCTCGACCCTCGG 50559537 50559538 CCCAGTGCCCCTTCCCGCGCGCGCGGGTCTCCCCGGTTCCAGAGCCCACCGGTCCCCGCC 50559597 50559598 GGCTCCTTCTCCCCACCCACCCTCCCACCGGGCCCCCGGCGGCTGCAGCCGCGCGGGGCT 50559657 50559658 GGCGGGGCGGCGACCGGGCTCAGGCAGATCCCCGCTTCCCGCCTTCTCGGCGCCCCCTCC 50559717 50559718 CTCCCGGACGGAGCCCGAGGATCCCCCACCCACGGCGGGCGTGAGGAAGGGCTTCTGAGT 50559777 50559778 GACTGGAGCTCTACCGCGTGTGCCCCGGGAAGGCCAGGCTACCCGGGACGGGGCTCGGCT 50559837 50559838 CCCCAGGTGAGCTCGTCTCCGCGGGACTGGGTCCGGGAAGGCCCCAGGACCGCGCGGCTG 50559897 50559898 AGCGGCCTGGAGGCTGCGGGAGGGCAGAGCAGGGCGCGCGGGAGACTGCCGCCCCCGGGC 50559957 50559958 GCCCAGGGCCCGGCTCCCCAGCGCCACCGCCGCAGCAGGTGGGGGCCCAGTGGGCGGGGG 50560017 50560018 CGGGGCCCGGCTCTGGGCGGAGCCGAGGCGGCGGCGGCGCAGGCTGGGGCCGGGGCCGGG 50560077 50560078 GCGGGAGCCGGAGCCCGAGCTGGAGCAGCGAGCCGGGCTGTCGGGGCGACCGCGGGAGCT 50560137 50560138 CGCCGTGCGCCGTGGCTGGGACCGGCCTGGCCGAGCGCGCCGGCGCCGCGGCCGCAGACA 50560197 50560198 AAGGGCGGCTCGCGCCCGGGCCGCCACGCTCTCGGGCTCTGCCTCGGTAAGTGGCTCCCC 50560257 50560258 TCCGCTGGCTTTCTCCTCCCGCCGCCTGCGCCTCTCGGAGTTCGGCGGGCTCCGGAGAAG 50560317 50560318 CGGGGAAGAGATGAGACTTCCCCGCCCGCACTGCCTCCCCACCTTACCCTAACAATAAGC 50560377 50560378 CCCCCAGGCCAAGCCACTGCCAAACTAGCGAGTTTCCGAGCGGCGGGGGTCTCCCGCGGG 50560437 50560438 ACCCGCCCGGCTGCCCTGGGTGAGCTCCTCGCCTGCAGACCGCGCGCCGGTGCTGTCCTG 50560497 50560498 GACCCGTTTGGGATGGGAGGTTGCCGCTGGGCTCCTCGCGTTGTGTTTAGGGGAGGAGGA 50560557 50560558 CGCAGGGGCCGGGCGCCGCTAGGGGACCCCACCCCCGGGGACAGTCCGGAGCGCTTGGGG 50560617 50560618 TCGCCGAGGGGCAGTTCACACTGCGAGTTCAGATTCGGATCGCAGTCCCGATTATCCTCC 50560677 50560678 CCTCCAGCCTCTCCCTTTCTCGTTGAAGGGTTAATACAGCGTCCTCTCCCCTCGCCACCC 50560737 50560738 GACAGAGGCGCCTACACTGGCGGTAGGTAGCCCCTGGGAGAGGGGGAGTGGGGGGACCCC 50560797 50560798 GCCGCTTTCGCCGCTGGGCGACCCAGAGCCCCAGCCTGCCGGAGAGGGCAGCGGCTCGGG 50560857 50560858 TTTGACATCCCAGCTGGGTCCCGGGCCGGCTCCCTGAGCCTCCTCCCGGGTTGCTCTCTA 50560917 50560918 TCAGGAAAGCAATCGGAAGTCAGGCCGGCTTTTGCTTTTGTTCTGCCAGCTACTCTACGG 50560977 50560978 AATCGTAGGTGAAGCCGGGGTGGGCGGATGCCCCGGGAGGGGGCTGTGGCGGGAGTTCCA 50561037 50561038 GGTGCGTCCCCGAAATGACCATTGGAGGCGGCGGCTGTTTCCCGCCCCTGGGTGGGGAAT 50561097 50561098 GGATTCCGATCGCTAATCGATACCCTGGAGCCAGCAGTGGGTCAGCAGCGTCCCGACAGA 50561157

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2. 在Filters的GENE中输入MAPK4的登录号，Attributes中选择输出六个物种的旁系同源序列与人类的直系同源序列的蛋白和基因的ID号。将输出的基因和蛋白ID保存，用于同源序列下载。序列下载时，先选择对应的Dataset，同源基因Attributes选择序列（未剪切基因），Filters的GENE设为Gene stable ID，同源蛋白下载时，Attributes选择序列(peptide)，将Filters的GENE设为Protein stable ID，将

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序列导出为fasta格式。（附下载序列）

Biomart下载的同源序列登录号 目标基因ID ENSG 同源序列 同源基因ID ENSMPUG ENSFALG ENSTRUG 直系同源序列 ENSDNOG ENSCAPG ENSCING ENSCSAVG ENSG 旁系同源序列 ENSG ENSG 同源蛋白ID ENSMPUP ENSFALP ENSTRUP ENSDNOP ENSCAPP ENSCINP ENSCSAVP ENSP ENSP ENSP ensemble人类MAPK4旁系同源蛋白.txtensemble人类MAPK4直系同源蛋白.txtensemble人类MAPK4直系同源基因.txtensemble 人类MAPK4旁系同源基因.txt

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