miRNA在重度子痫前期与正常妊娠胎盘组织中差异表达的
研究
蒋涛涛,孙 波*,沈 梅,董 洁,骆 琦
【摘 要】摘要:目的分别检测重度子痫前期和正常妊娠妇女胎盘组织中微小RNA(miRNA)的表达情况,并初步探讨miRNA的差异表达在重度子痫前期发生发展过程中的意义。方法 在我院住院剖宫产分娩的产妇中,选取5例重度子痫前期患者(实验组),5例正常妊娠孕妇(对照组),通过miRNA芯片技术检测实验组与对照组胎盘组织中miRNA的表达情况。结果 本实验共检测了391个miRNA的表达谱,实验组与对照组组间比较,差异表达的miRNA共有81个,其中表达上调的有80个,表达下调的有1个,主要涉及细胞分化、血管重塑、内分泌调节等多方面的功能。结论 重度子痫前期患者胎盘组织中miRNA的表达失调可能参与了重度子痫前期的发病及病理生理过程。 【期刊名称】中国实验诊断学 【年(卷),期】2015(000)010 【总页数】4
【关键词】重度子痫前期;胎盘;miRNA;差异表达 (Chin J Lab Diagn,2015,19:1707)
子痫前期(preeclampsia,PE)是以高血压、蛋白尿等为主要临床症状的妊娠期特有疾病,国外统计其发生率为2%~8%,与孕产妇妊娠期死亡、早产及新生儿死亡密切相关[1]。其发病机制尚不清楚,但目前研究认为胎盘的病理状态与其相关[2,3]。微小RNA(m i R N A)属于单链非编码RNA,长约22个核苷酸,主要在基因的表达调控中发挥重要作用[3]。近年研究发现,胎盘
组织中miRNA表达失调可能参与了重度子痫前期的发生,然而不同研究检测出的差异表达的miRNA不尽相同[3-7]。为进一步研究miRNA与重度子痫前期的相关性,本实验应用miRNA芯片技术比较sPE患者和正常妊娠孕妇的胎盘组织中miRNA的表达情况,并初步探讨miRNA在重度子痫前期病理生理过程中的作用机制。
1 资料和方法
1.1 一般资料 选取2014年3月至2014年5月期间在我院住院分娩的单胎初产妇共10例,其中5例sPE患者作为实验组,5例正常妊娠孕妇作为对照组,两组在年龄和孕周方面无统计学差异(P>0.05),研究对象既往均无特殊病史,重度PE诊断标准依据苟文丽主编的《妇产科学》第八版标准。 1.2 方法
1.2.1 标本采集 胎盘娩出后5min内,在胎盘母体面无钙化区和出血点的部位采集数块面积约1× 1cm的胎盘组织,并在生理盐水中反复漂洗去除血污,干纱布吸除水分后及时放入液氮中,-80℃的冰箱保存。
1.2.2 样本总RNA的提取质检和纯化 按照Trizol法(北京博奥晶典)提取各个胎盘组织的总RNA,先予分光光度计定量,随后通过甲醛变性胶电泳试验质检总RNA的质量是否合格。对质检合格的总RNA使用mirVanaTMmiRNA Isolation Kit(AM1561)进一步纯化,并在纯化后再次用分光光度计定量。 1.2.3 纯化RNA的去磷酸化及标记 取纯化后的RNA 200ng,使用Agilent公司的miRNA Complete Labeling and Hyb Kit,主要步骤包括:①纯化后的miRNA5’端磷酸基团使用碱性磷酸酶CIP去除,此步为去磷酸化;②使用试剂盒中的T4RNA链接酶把Cyanine3-pCp连接到RNA3’端,完成标记;
③将浓缩抽干的miRNA放在杂交炉中过夜,完成杂交。备注:标记外标(Labeling spike-in)RNA和杂交外标(Hyb spike-in)RNA作为整个实验过程中的质控。
1.2.4 芯片清洗及扫描 先将过夜杂交的芯片置于2×SSC和0.2%SDS的混合洗液中浸泡5min,甩干玻片,再置于0.2×SSC洗液浸泡5min,洗液温度均控制在42℃左右,甩干玻片,将芯片置于使用Agilent芯片扫描仪(G2565CA)中扫描获得杂交图片。
1.2.5 统计学处理 杂交图片使用Agilent Feature Extraction(v10.7)软件进行分析后获得原始数据,原始数据需经Agilent GeneSpring软件进一步统一化处理,随后即可用GeneSpring软件对处理后的数据统计分析。FC表示两组或两个样品之间的差异倍数;以2为底、Log FC的绝对值为幂得到的对数即为FC(abs),FC(abs)值越大,表示两个样品之间的差异越大。差异表达基因筛选标准:FC(abs)>2.0,且P<0.05。
1.2.6 miRNA靶基因预测 通过序列查询http://www.mirbase.org/index.shtml和靶基因预测http://www.umm.uni-heidelberg.de/apps/zmf/mirwalk/index.html初步探究差异表达的miRNA在重度子痫前期病理生理过程中的调节作用。
2 结果
本实验共检测出81个差异表达的miRNA,其中仅miR-135b-5p表达下调,其余80个miRNA均表达上调,目前有16个miRNA已知其在染色体定位及靶基因,见表1,其中miR-188-5p、miR-362-3p和miR-532-3p位于同一基因簇Xp11.23上。