目的:
验证X-pPR3-N、Y-pPR3-N和Bait-pBT3-STE,是否为相互作用的关系。
方法:
将构建到pPR3-N载体上的X、Y基因及构建到pBT3-STE的Bait基因,通过共转的方法转化至酵母菌株NMY51,确定X-pPR3-N、Y-pPR3-N和Bait-pBT3-STE是否为相互作用的关系。
材料:
1. 诱饵克隆:X、Y-pBT3-STE
猎物克隆:Bait-pPR3-N 2.载体:pBT3-STE、pPR3-N 3.Clontech酵母双杂交系统 4.培养基:
1). 酵母完全培养基:
YPDA:1% Yeast extract,2% Tryptone,2% Glucose, 0.02% Adenine。 2). 酵母缺陷型筛选培养基:
参照Clontech公司的PT3024-1/Yeast Protocols Handbook。其中各种培养基分别以下列符号表示:
SD-TL:-trp, -leu; SD-TLH:-trp, -leu, -his; SD-TLHA:-trp, -leu, -his, -ade。 3). 其他贮备液:
10 × TE:0.1 M Tris-HCl(pH7.5),10 mM EDTA,高压灭菌; 10 × LiAc:1 M LiAc (pH7.5),高压灭菌;
第一部分 将质粒转化受体菌NMY51中
1.1酵母转化
将以下质粒分别转入NMY51中: Reaction
1 2 3 4 5 6
1.2 酵母转化方法
1.从YPDA平板挑取NMY51单菌落接种于YPDA液体培养基4 ml,30℃,225 rpm,振荡培养18-20 h(过夜),至OD600>1.5。
2.转接YPDA液体培养基,培养体积为50 ml,使初始OD600=0.2,30℃,225 rpm,振荡培养4-5 h,至OD600=0.6-0.8。
3.离心收菌,室温,4000 rpm,5 min。
4.用20 ml无菌水重悬菌体,混匀,离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清。 5.用5 ml 0.1 M LiAc重悬菌体,混匀,离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清。 6.用500 ul 0.1 M LiAc重悬菌体,混匀,分装至1.5 ml离心管,每个50 ul(每个转化),备用。
7.每个1.5 ml离心管中依次加入如下试剂,用枪头吹打混匀,或剧烈振荡1 min左右,至完全混匀。
50%PEG3350
240 ul
8. 30℃水浴孵育,30 min。
1 M LiAc 36 ul
ssDNA (20 mg/ml)
5 ul
质粒DNA 各5 ul
pPR plasmid X-pPR3-N Y-pPR3-N pPR3-N X-pPR3-N Y-pPR3-N pPR3-N
pBT plasmid Bait-pBT3-STE Bait-pBT3-STE Bait-pBT3-STE pBT3-STE pBT3-STE pBT3-STE
涂板种类 SD-TL SD-TL SD-TL SD-TL SD-TL SD-TL
备注 实验组 实验组 对照组 对照组 对照组 对照组
9. 42℃水浴热激,25 min。 10.30℃水浴复苏,30 min。
11.离心收菌,室温,4000 rpm,5 min,弃上清。
12.每个转化用200 ul无菌水悬浮菌体,尽量温和地混匀,涂布相应的缺陷型筛选平板。 13.30℃恒温培养4天 1.3 检测结果
从实验组X-pPR3-N和Bait-pBT3-STE、Y-pPR3-N和Bait-pBT3-STE,对照组pPR3-N和Bait-pBT3-STE、X-pPR3-N和pBT3-STE、Y-pPR3-N和pBT3-STE、pPR3-N和pBT3-STE,共转NMY51长出的酵母转化子随机各挑取了8个单菌落进行PCR检测并保菌。从PCR检测正确的单菌落中随机各挑取1个进行点板。
图1. 检测结果
pBT3-STE-Bait的筛选压力为20mM 3AT
由图中可知,从实验组X-pPR3-N和Bait-pBT3-STE在SD-TLHA+10 mM 3AT、SD-TLHA+20 mM 3AT板上不生长,因此X-pPR3-N和Bait-pBT3-STE可能不发生互作关系;实验组Y-pPR3-N和Bait-pBT3-STE在SD-TLHA+20 mM /30mM/40mM 3AT板上生长,并且点板验证的筛选压力超过了pBT3-STE-Bait自激活的验证的20mM浓度,因此实验组Y-pPR3-N和Bait-pBT3-STE是互作的,并且互作强度较强。