拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因cDNA克隆及其序列特征分析

拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因cDNA克隆及其序列特

征分析

王丽;张俊莲;张金文;刘玉汇;白江平;余斌;杨宏羽;王蒂

【期刊名称】《草业学报》 【年(卷),期】2013(022)006

【摘要】以NaCl胁迫处理的拟南芥幼苗叶片为材料,用RNA提取试剂盒抽提总RNA,通过RT-PCR技术和DNA序列测定分析,证实获得了拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因(AtHKT1)的cDNA序列.该cDNA全长1521 bp,包括506个氨基酸和1个终止密码子序列,且与原序列(accession number AF237672)同源性为99.34％,但与其他科植物HKT1基因同源性较低,注册该基因到GenBank中,注册号为AY685182.利用生物信息学相关软件分析预测AtHKT1基因蛋白质功能和结构,结果发现,该蛋白分子量为57.45 kD,理论等电点为9.33;氨基酸序列中第1～40个氨基酸属信号肽序列;第152～500个氨基酸属Trk H阳离子转运体蛋白保守结构域,并存在蛋白激酶C,酪氨酸蛋白激酶,依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化,糖基化和豆蔻酰化等功能位点;该基因编码的蛋白有10个跨膜结构,N末端、C末端及中部等多个跨膜区具疏水性,符合载体类运输蛋白特点.表明本研究获得了拟南芥AtHKT1基因. 【总页数】9页(230-238)

【关键词】拟南芥;高亲和性K+载体蛋白;RT-PCR技术;生物信息学分析 【作者】王丽;张俊莲;张金文;刘玉汇;白江平;余斌;杨宏羽;王蒂

【作者单位】甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃兰州730070;甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃兰州730070;甘肃省干旱生境作物学重点实