基于FIASCO技术的芝麻SSR标记及其遗传多样性分析
陶 菲a,童益琴a,赵 杰a,南 皓a,杨立春a,李江浩a,葛台明a,b
【摘 要】摘要:采用FIASCO法构建了芝麻(Sesamum indicum L.)GATA\AAAG\AAAC微卫星富集文库,阳性克隆率62%,其中58%为完美型SSR。利用30个芝麻材料对其中10个扩增稳定、多态性好的SSR位点进行了多样性分析,等位基因数介于4~7之间,平均6.2个;有效等位基因数介于2.18~5.13之间,平均3.73。25个育成品种(系)遗传相似系数平均为0.740 7,遗传距离平均为0.258 9;5个地方品种间的遗传相似系数平均为0.659 3,遗传距离平均值为0.312 8,说明地方品种多样性比育成品种(系)丰富。AMOVA分析表明,品种(系)间变异大于品种(系)内变异,地方品种种内变异大于育成品种(系)。聚类分析表明,一把白与所有育成品种(系)聚为同一类。研究还鉴定出一些遗传差异较大的材料。 【期刊名称】湖北农业科学 【年(卷),期】2015(054)011 【总页数】8
【关键词】芝麻(Sesamum indicum L.);SSR标记;FIASCO;遗传多样性 芝麻(Sesamum indicum L.)为胡麻科(Pedaliaceae)胡麻属(Sesamum)一年生草本植物,是世界上最古老的油料作物之一。芝麻种植区主要分布在温带和热带,其中印度、缅甸、苏丹和中国是较大的生产国。芝麻营养价值很高,富含蛋白质、氨基酸及丰富的矿物质、粗纤维及多种维生素[1]。早期芝麻遗传学研究多注重在形态学[2-4]及细胞学[5-8]特征上,这些标记因重复性差、标记数量少而未被广泛应用。DNA分子标记因不受环境影响,稳定性好