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生物项目数据库(BioProject)使用说明 

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生物项目数据库(BioProject)使用说明

数据库简介 ........................................................................................................... 2 用户注册 ............................................................................................................... 2 BioProject创建 .................................................................................................... 3

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数据库简介

生物项目数据库(BioProject)是收集与共享生物学研究项目信息的资源库,涵盖的项目类型包括常规组学研究的基因组、转录组、表观组和宏基因组等,并针对大型项目提供高效、安全、专业化的项目分级管理。

用户注册

用户可借助于中心单点登录(BIG Single Sign-On,BIG SSO)技术,通过BIG Submission主页http://bigd.big.ac.cn/gsub/完成用户账号注册,建议使用实验室公共邮箱进行注册。如果您在账号使用过程中遇到任何问题,请联系bigd-admin@big.ac.cn。

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BioProject创建

账户注册完成后,即可进入BIG Sub统一递交入口,目前BIG Sub已集成BioProject、BioSample、GSA、GWH、GVM、BioCode等数据库的提交接口, 如果用户需要向递交组学原始数据归档库(Genome Sequence Archive)、基因组序列库(Genome Warehouse)、或基因组变异数据库(Genome Variation Map)等数据库递交数据(BioCode数据库除外),都必须先进入BioProject数据库创建BioProject并完成相关信息填写,具体操作步骤如下:

注:如果用户需要向生物信息工具库(BioCode)递交开源生物信息软件工具,可直接进入BioCode数据库按步骤进行工具递交。

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Release Date的设置时间,用户可根据项目需求进行设定,但最长不要超过2年。

目前本系统Umbrella Project功能只对中国科学院战略性先导科技专项开发,其他项目此项不必填写。

请选出项目资金来源机构

注:eGPS:evolutionary Genotype-Phenotype biology为先导B动物复杂性状的进化解析与调控项;

MMDB:Molecular Module-based Designer Breeding System为先导A分子模块设计育种创新体系项目。

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Project Data type支持多选,Project Data type列表中不包括的测序类型,可以选择others并在Project Data type description中自行添加。

Monoisolate:同一物种且同一基因型样本,主要用于模式动物/植物或细胞系等。 Multiisolate:同一物种的多基因型的个体样本 Multi-species:多物种样本集

Environment:环境样本集,样本的种类含量尚不清楚,多用于宏基因组研究 Synthetic:在实验室里制造/合成的样本 Single cell:单个细胞测序得到的序列信息 Other:其他样本/无法归入以上类别的特殊样本

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点击Submit Project完成BioProject创建。

注:用户完成BioProject创建后,Status状态为Finish; Cofidential,系统将自动为用户生成Accession number。在管理员审核通过之前,用户可在BioProject界面随时修改和删除所创建的BioProject。管理员审核通过后,Status状态会变为Checked OK; Cofidential,到达用户设定的发布日期后,会变成Checked OK;Public。

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生物项目数据库(BioProject)使用说明 

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