SARS冠状病毒主要蛋白酶二聚体静电和疏水效应的研究

SARS冠状病毒主要蛋白酶二聚体静电和疏水效应的研究

郑柯文;俞庆森;王艳花;张兵;胡桂香

【期刊名称】《化学学报》 【年(卷),期】2004(062)006

【摘要】从三种冠状病毒主要蛋白酶SARS 3CL, HCoV 3CL和TGEC 3CL蛋白酶结构出发,着重研究了三种蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用.用连续介质模型有限差分方法计算得到三种蛋白二聚体界面处的静电势,发现三种蛋白酶单体和单体之间静电势分布具有明显的互补性,三种蛋白酶二聚体单体之间具有相同的静电相互作用能.用溶剂可及表面积模型分析了分子表面积及疏水性,发现三种蛋白酶具有相同的疏水分布,其中SARS 3CL蛋白酶疏水率为74%,驱动其单体聚合成二聚体.对三种蛋白酶的去溶剂化能疏水项的计算表明,三种蛋白酶二聚体单体之间具有相似的疏水相互作用能. 【总页数】8页(542-549)

【关键词】SARS冠状病毒3CL蛋白酶,静电相互作用,疏水相互作用,二聚体 【作者】郑柯文;俞庆森;王艳花;张兵;胡桂香

【作者单位】浙江大学宁波理工学院药物分子设计与营养工程重点实验室,宁波,315100;浙江大学宁波理工学院药物分子设计与营养工程重点实验室,宁波,315100;浙江大学宁波理工学院药物分子设计与营养工程重点实验室,宁波,315100;浙江大学宁波理工学院药物分子设计与营养工程重点实验室,宁波,315100;浙江大学宁波理工学院药物分子设计与营养工程重点实验室,宁波,315100 【正文语种】中文