出血性大肠杆菌O157∶H7的脉冲场凝胶电泳分型方法研
究
黄彦;方志峰;孙贵娟;唐振柱;李秀桂;王红;吕素玲;蒋震羚;车光;黄兆勇
【期刊名称】《应用预防医学》 【年(卷),期】2007(013)001
【摘要】目的 应用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对肠出血性大肠杆菌O157:H7进行基因分型,了解不同来源分离株的相关性.方法 选择在广西食品污染物检测地区食品样本中分离到的7株出血性大肠杆菌O157:H7,采用琼脂糖包埋胶块法制备基因组DNA,以Xba Ⅰ限制性内切酶进行酶切,选定脉冲电泳参数进行脉冲场凝胶电泳,照相记录结果;Nei的公式计算相似性和遗传距离,并用PHYLIP程序非加权成对算术平均法聚类分析.结果 PFGE可生成14～18条清晰条带的分离株DNA指纹图谱,由聚类分析树状图可将7株分离株分为6个基因群.结论 广西不同地区食品分离O157:H7血清型菌株存在多个分子亚型,提示不是一个克隆株,研究发现脉冲场凝胶电泳分型技术重复性高,在分子流行病学研究中有较大的应用前景.
【总页数】4页(19-22)
【关键词】出血性大肠杆菌O157:H7;脉冲场凝胶电泳;聚类分析
【作者】黄彦;方志峰;孙贵娟;唐振柱;李秀桂;王红;吕素玲;蒋震羚;车光;黄兆勇 【作者单位】广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;
广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021;广西壮族自治区疾病预防控制中心,南宁,530021 【正文语种】中文 【中图分类】R1 【相关文献】
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出血性大肠杆菌O157∶H7的脉冲场凝胶电泳分型方法研究
