09129生物信息学

《生物信息学》课程（09129）教学大纲

一、课程大体信息 课程中文名称：生物信息学 课程代码：09129

学分与学时：2学分，38学时 课程性质：专业选修 讲课对象：生物工程专业 二、课程教学目标与任务

课程教学目标：生物信息学以现代分子生物学数据作为要紧研究对象，进展理论模型和计算方式，揭露以基因组信息结构为主的生物复杂性，和生长、发育、遗传、进化等生命现象的全然规律。本课程要紧教学生物信息学基础知识、生物信息数据库的利用、生物信息工具的应用和相关算法等方面的内容。第一介绍生物信息学的进展和现状，然后介绍生物信息学中几种要紧数据库的内容、注释、检索和数据库搜索工具的利用方式，包括两序列比对、多序列比对及其算法等，并结合现此生物信息学领域的最新进展，讨论上述各类方式在实际研究中的应用（包括基因序列信息分析、基因预测、分子进化及系统发育树和蛋白质结构预测等重要问题）。本课程注重学科交叉、融合，以介绍思想、方式为主，深切浅出，幸免繁琐、抽象的数学形式，启发学生综合运用数学、物理、工程科学和运算机知识的能力，拓宽知识面，了解学科前沿和最新进展，培育跨越生命科学、计算科学、数理科学等不同领域的\大科学\素养和意识，为尔后选择新兴交叉学科领域进行深造奠定基础。 课程教学任务：

1．介绍生物信息学的要紧内容和以后可能的进展方向，为学生构建相关知识体系，开阔学生的视野，为以后进一步学习、科研打下基础；

2．让学生了解生物信息学的大体研究方式，并能把握应用其中的一些经常使用方式，以提高学生的科研能力；

3．学习运用运算机软件来分析生物学问题。

三、学时安排

课程内容与学时分派表

章节 第一章 第二章 第三章 第四章 第五章 第六章 第七章 内容 第一章 绪论——生物信息学概述 基因工程生物信息学研究的基本内容与基本原理 主要生物信息学数据库功能及使用介绍 DNA序列分析 蛋白质序列分析 核酸和蛋白质序列的比对 生物信息学工具的应用 学时分配 2 3 6 6 6 6 9 四、课程教学内容及大体要求 第一章 绪论——生物信息学概述

教学目的：详细讲解生物信息学的大体概念，介绍生物信息学的进展现状，生物信息学在人类基因组研究打算中的应用研究进展史。 大体要求：

1． 把握生物信息学的大体概念。 2．了解生物信息学的进展现状

3．了解生物信息学在人类基因组研究打算中的应用研究进展史。。 重点与难点：生物信息学在人类基因组研究打算中的应用

要紧内容：

1. 生物信息学的大体概念。 2．生物信息学的进展现状

3．生物信息学在人类基因组研究打算中的应用研究进展史。。 教学方式：教学、多媒体、上机操作。

第二章 生物信息学研究的大体内容与大体原理

教学目的：详细讲解生物信息学研究的大体内容 ；介绍生物信息学数据库的成立；生物 信息学专业人材的培育 ；生物信息学数据库的理论研究。

大体要求：

1. 把握生物信息学研究的大体内容 ；

2. 了解生物信息学数据库的成立；生物信息学专业人材的培育 ；生物信息学数据库的理

论研究。

重点与难点：重点：生物信息学研究的大体内容；难点：生物信息学数据库的成立 要紧内容：

1. 生物信息学研究的大体内容 ； 2. 生物信息学数据库的成立； 3. 生物信息学专业人材的培育 ； 4. 生物信息学数据库的理论研究。 教学方式：教学、多媒体、上机操作

第三章 要紧生物信息学数据库功能及利用介绍

教学目的：讲解Genbank 核酸序列数据库 ；Swiss-Port 蛋白质序列数据库；PDF生物大分子结构数据库 ；PIR 蛋白质数据库 ；数据库的检索其它数据库功能及利用介绍 大体要求：1.了解各数据库

2.把握数据库的检索及数据库功能

教学重点及难点: 数据库的检索及功能 要紧内容：

1. Genbank 核酸序列数据库 ； 2. Swiss-Port 蛋白质序列数据库； 3. PDF生物大分子结构数据库 ； 4. PIR 蛋白质数据库 ；

5. 数据库的检索其它数据库功能及利用介绍 教学方式：教学、多媒体、上机操作

第四章 DNA序列分析

教学目的：讲解DNA序列分析的意义；详细教学基因结构与DNA序列， DNA序列分 析及其工具；核酸序列的预测与鉴定；介绍核酸序列物理性质的计算 大体要求：