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Rv3457 c基因及其编码蛋白基本特性及抗原表位的生物信息学分析

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Rv3457 c基因及其编码蛋白基本特性及抗原表位的生物信

息学分析

赵隆麒;王心倩;孙妍;占卫红;吴启航;李海波;余晓丽

【期刊名称】《武汉工业学院学报》 【年(卷),期】2016(035)004

【摘要】运用生物信息学对Rv3457 c基因编码蛋白的主要特征进行分析,同时预测并筛选其T/B细胞表位.运用ProtParam、SingnalP、TMHMM来分析基因编码蛋白的理化性质、信号肽区、跨膜区;运用NetMHC、Bimas、NetCTL和SYFPEITHI对其T、B细胞进行细胞表位分析预测.得到该基因编码蛋白由1044个氨基酸组成,原子数为10498,理论分子式为C2980 H4918 N1044 O1216 S340,分子质量为85.7284 KD,等电点的理论值为4.99,半衰期估计值4.4 h,不稳定系数52.31,平均亲水性0.938,脂肪系数20.11;含有潜在T细胞表位和B细胞表位.得出至少含有一个T细胞和一个B细胞表位,可作为疫苗的研制提供基础.

【总页数】5页(26-30)

【关键词】Rv3457c;生物信息学;细胞表位

【作者】赵隆麒;王心倩;孙妍;占卫红;吴启航;李海波;余晓丽

【作者单位】武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉430023;武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉430023;武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉430023;武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉430023;武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉430023;武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉430023;武汉轻工大学 生物与制药工程学院,湖北 武汉

430023

【正文语种】中文 【中图分类】Q93 【相关文献】

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Rv3457 c基因及其编码蛋白基本特性及抗原表位的生物信息学分析

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