CRISPR/Cas9 基因敲除技术
CRISPR/Cas9（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats）是一种由RNA指导的Cas9核酸酶对靶向基因进行编辑的技术。
CRISPR/Cas9是细菌和古细菌为应对病毒和质粒不断攻击而演化来的获得性免疫防御机制。目前，来自Streptococcus pyogenes 的CRISPR-Cas9 系统应用最为广泛。在这一系统中，crRNA（CRISPR-derived RNA）通过碱基配对与转录激活crRNA（trans-activating RNA，tracrRNA）退火结合形成双链RNA能特异性识别基因组序列，Cas9 蛋白（含有两个核酸酶结构域，可以分别切割DNA 两条单链。Cas9 首先与crRNA 及tracrRNA结合成复合物，然后通过PAM 序列结合并侵入DNA，形成RNA-DNA 复合结构，进而对目的DNA 双链进行切割，生成DNA 双链断裂（double-strand breaks, DSBs）。在基因组编辑过程中，tracrRNA和crRNA可以融合成为1条RNA（sgRNA）表达同样可以起到靶向剪切的作用。
通过基因工程手段对crRNA 和tracrRNA进行改造，将其连接在一起得到sgRNA
（singleguide RNA）。融合的RNA 具有与野生型RNA 类似的活力，但因为结构得到了简化更方便研究者使用。通过将表达sgRNA的原件与表达Cas9 的原件相连接，得到可以同时表达两者的质粒，将其转染细胞，便能够对目的基因进行操作。
由于PAM 序列结构简单（5’-NGG-3’），几乎可以在所有的基因中找到大量靶点，因此得到广泛的应用。
与锌指核酸酶（ZFNs）和转录激活样效应核酸酶（Transcription activator-like effector nucleases,TALEN）相比较，CRISPR-Cas系统介导的基因组靶向实验在真核细胞中具有相似甚至更高的效率。
CRISPR/Cas9 系统可广泛应用于基因组工程，如基因抑制，基因敲除，基因敲入，基因修复等。CRISPR-Cas9 体系的RNA-DNA 识别机制为基因组工程研究提供了一项简便而强大的工具。其最重要的优势是Cas9 蛋白可在多个不同的gRNA 的引导下同时靶向多个基因组位点，起到多靶点调控的作用。
起源：
1、2007年，来自丹尼斯克公司（一家总部位于丹麦哥本哈根的食品添加剂公司，目前被杜邦公司收购）的科学家找到了一种能增强细菌防御噬菌体能力的方法。
2、2013年，四个研究团队报告了这一被称为CRISPR的系统，自此CRISPR技术红红火火的发展了起来，许多科研团队利用它来删除、添加、激活或抑制人体、老鼠、斑马鱼、细菌、果蝇、酵母、线虫和农作物细胞中的目标基因。
3、2015年，蒙大拿州立大学的两位学者以―CRISPR-RNA-Guided Adaptive Immune Systems‖为题，介绍了CRISPR-Cas免疫应答系统。
其中Blake Wiedenheft就是当年加州大学伯克利分校Jennifer Doudna研究组成员，他们曾于2010年破解了Csy4核糖核酸内切酶原子水平的晶体结构模型——研究人员确定Csy4是一种存在于原核细胞的酶，它能够启动生成CRISPR衍生RNAs (crRNAs)，这种小RNA分子能够靶向并沉默侵入的病毒和质粒。
CRISPR 与RNAi 的区别
目前已经广泛应用的RNAi 技术的靶标是mRNA，而CRISPR 通过RNA 识别DNA 序列然后再改变DNA 序列，是可以遗传的。由于编码mRNA 的DNA 序列只占总DNA 的极少部分，因此靶向DNA 序列的CRISPR 的靶标要比RNAi 广得多，更有可能筛选出针对某DNA 序列的特异CRISPR 靶标。
CRISPR/Cas9特点和缺点：
CRISPR/Cas9的优点是操作简单，对基因组的效率高。需要对某一个靶位点编辑的时候，只需要表达相应的sgRNA即可，不需要对Cas9核酸酶进行改造。它可对任何物种的基因组进行高效率的定向编辑。
1、操作简单，靶向精确性更高。
sgRNA靶向序列和基因组序列必须完全匹配，Cas9 才会对DNA 进行剪切。编码sgRNA的序列不超过100bp，因此比构建TALENs 和ZENs更简单方便，用于CRISPR 的sgRNA识别序列仅需20 个核苷酸。
2、CRISPR/Cas9 系统是由RNA 调控的对DNA 的修饰，其基因修饰可遗传。 3、基因修饰率高，基因调控方式多样，例如敲除、插入、抑制、激活等 4、可实现对靶基因多个位点同时敲除。 5、无物种限制。
6、实验周期短，最快仅需2个月，节省大量时间和成本。
基因组编辑技术的一个缺点是脱靶效应，可能在靶点以外的地方切断DNA，产生indel。
CRISP原理
