miR-199a-3p 靶基因预测及生物信息学分析

miR-199a-3p 靶基因预测及生物信息学分析

谢小娟;潘晶晶;魏力强;陈葳

【摘 要】目的：为深入研究 miR-199a-3p 在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析 miR-199a-3p 序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行 GO 富集和 KEGG Pathway 分析；构建 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果miR-199a-3p 序列在多物种间具有高度保守性；GO 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P <0.01)；KEGG Pathway 分析发现 miR-199a-3p 的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM 受体的相互作用通路、PI3K-Akt 信号通路、MAPK 信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等；根据构建的 TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受 miR-199a-3p 调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论miR-199a-3p 可能通过直接靶向作用 mTOR,调节 PI3K-Akt-mTOR 信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。 【期刊名称】《西安交通大学学报（医学版）》 【年(卷),期】2016(000)002 【总页数】6页(P244-249)

【关键词】miR-1 99a-3p;生物信息学;mTOR;GO 富集分析;KEGG Pathway 分析;膀胱癌;PI3K-Akt;MAPK;蛋白聚糖 【作 者】谢小娟;潘晶晶;魏力强;陈葳

【作者单位】陕西省临床检验中心，陕西西安 710068; 西安交通大学第一附属医院检验科，陕西西安 710061;西安交通大学第一附属医院检验科，陕西西安