目录
1 材料与方法.....................................................................................................................................1
1.1 菌株的保存与培养..............................................................................................................1 1.2 蛋白可行性分析 ..................................................................................................................1 1.3 载体构建 ..............................................................................................................................2 1.4 大肠杆菌TOP10感受态的制备与转化 ............................................................................2 1.5 毕赤酵母GS115感受态的制备与转化 .............................................................................3 1.6 蛋白表达、纯化与鉴定 ......................................................................................................4
2 结果与分析.....................................................................................................................................4
2.1 蛋白可行性分析 ..................................................................................................................4 2.2 蛋白表达鉴定 ......................................................................................................................5
1.材料与方法
1.1.1 菌株的保存与培养
大肠杆菌(Eschrichia coli)菌株TOP10于LB培养液摇菌后保存成20%的甘油菌于
-80℃冷冻保存。毕赤酵母(Pichia pastoris)菌株GS115于YPD培养液摇菌后保存成30%的甘油菌于-80℃冷冻保存。大肠杆菌于37℃培养箱中培养。毕赤酵母于28℃培养箱中培养
1.1.2 试剂的配置
LB培养基 蛋白胨 NaCl
10 g/L 10 g/L 5 g/L
酵母提取物
加水溶解,调节pH至7.0,定容至1 L,固体培养基加入20 g/L琼脂,121℃灭菌20 min。
TB buffer PIPES
2 ml(0.5 M,pH6.7) 0.22 g 1.866 g 1.088 g
CaCl2·H2O KCl
MnCl2·4H2O
加水溶解,定容至100 ml,用0.22 μm过滤器过滤灭菌。
YPG培养基 酵母提取物 蛋白胨 甘油
BMMY培养基 酵母提取物 蛋白胨
10×YNB 10×PBS
5 g/L 10 g/L 1× 1×
5 g/L 10 g/L
1.2 蛋白可行性分析
信号肽预测使用SignalP 4.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-4.0/)和SignalP 5.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)。
N糖基化预测使用NetNGlyc 1.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/)。 蛋白质三维结构预测使用SWISS MODEL(https://swissmodel.expasy.org/interactive)。 1.3 载体构建 1.3.1 目的基因的克隆
1)基因X由客户提供。
1.3.2 重组质粒
1) 所用载体为LDF,酶切位点为XhoI和PstI;
图1 载体图谱
LDF载体图谱。
1.4 大肠杆菌TOP10感受态的制备与转化 1.4.1 大肠杆菌感受态的制备
1) 从甘油菌中活化TOP10,37℃培养(尽量划出单菌落);
2) 挑单菌落摇菌(LB液,MgSO4 20 mM(终浓度)),37℃ 200 rpm过夜; 3) 按1:50或1:100扩培到100 ml LB液体培养基中(MgSO4 20 mM(终浓度)),22℃ 200 rpm 4 h左右;
4) 待0D600= 0.2-0.3时,置于冰上10min; 5) 4℃ 3000 rpm离心10 min收集菌体,弃上清;
6) 15 ml TB Buffer悬浮,冰上放置10 min(TB Buffer预先于冰上预冷); 7) 4℃ 3000 rpm离心10 min收集菌体,弃上清; 8) 用10 ml感受态液体悬浮(0.6 ml DMSO+7.4 ml TB);
9) 按100 μl/管分装至1.5 ml EP管中,冰上操作,分装后迅速放于-70℃保存。 1.4.2 大肠杆菌感受态的转化
1) 吸取10 μl重组质粒到感受态细胞中,冰上放置30 min; 2) 42℃热激90 s,冰上放置5 min;
3) 于超净台中加入800 μl LB液体培养基,37℃ 220 rpm复苏1 h;
4) 4000 rpm离心5 min,保留100 μl LB悬浮菌体,涂布于相应抗生素的LB固体平板上,37℃过夜培养;
1.5 毕赤酵母GS115感受态的制备与转化 1.5.1 毕赤酵母电转感受态的制备
1) 从新鲜划线培养的P.pastoris GS115平板上接单菌落,转移至50 ml液体YPG培养基中,30℃ 200 rpm培养至OD600=1.0-1.5之间。
2) 4000 rpm离心5 min收集菌体,用10 ml酵母感受态母液重悬,室温静置30 min,每隔10 min轻柔颠倒混匀。4000 rpm离心5 min收集菌体。
3) 用10 ml预冷的1 M山梨醇重悬,然后4℃ 4000 rpm离心5 min,收集菌体。 4)重复上述步骤3次。
5)最后用200 μl预冷的1 M山梨醇重悬,分装至1.5 ml离心管中,每管80 μl,可直接使用或保存于-80℃。
酵母感受态母液:10 mM Tris-HCl,0.6 M山梨醇,10 mM DTT,100 mM LiAc,pH7.5.过滤除菌。
1.5.2 毕赤酵母感受态电击转化
1) 冰浴预冷0.2 cm电击杯,打开电击仪,调整电转参数:电压1.5 kV,电阻250 Ω,
电容25 μF。
2) 向制备好的酵母感受态细胞中加入2-5 μg DNA片段,轻柔吸打混匀后转移至电
击杯中,冰浴5 min。
3) 进行电转操作,电击结束后立刻向电击杯中加入1 ml预冷的1 M山梨醇,并吸
打混匀,然后转移至1.5 ml离心管中,于30℃培养箱中静置培养1 h。
4)室温下4000 rpm离心4 min,收集菌体,并用100 μl YPG重悬。
5)将细胞悬浮液涂布在含有100 μg/ml Zeocin的YPG平板上,30℃下培养3-5天。
1.6 蛋白表达、纯化与鉴定 1.6.1 蛋白诱导表达
1) 接种多个酵母单菌落于20 ml YPG中,30℃ 220 rpm培养2 d至菌液饱和。 2) 4000 rpm离心5 min,收集菌体,用20 ml BMMY重悬。
3) 加入0.75%(即150 μl)甲醇诱导表达,之后每隔24 h补加一次甲醇,一共需要加5次。25℃ 220 rpm诱导表达。
4) 第6天,室温4000 rpm离心5min收集上清,即为酵母外泌表达蛋白; 5) 分别进行考染与WB检测蛋白表达情况。 1.6.2 His标签纯化
1) 事先装好Ni-NTA beads重力柱(30 ml柱体积,包含5 ml Ni-NTA beads); 2) 打开塞子,让保护液流出,加入5 ml Lysis buffer清洗柱子,共洗3遍; 3) 加入20 ml上述诱导表达的蛋白,使蛋白按一定流速从下口流出; 4) 加入20 ml Wash buffer清洗,共洗6遍; 5) 加入2 ml Elution buffer洗脱蛋白,收集洗脱液。
6) 把洗脱液再加回柱子中,进行二次洗脱,重复3次,以彻底洗脱柱子上的蛋白并提高洗脱效率。 1.6.3 蛋白鉴定 1.6.3.1 WB检测
1) 取20 ?l蛋白溶液进行蛋白质电泳,先80 V跑出积层胶,后100 V至电泳结束; 2) 转膜,100 V 90 min;
3) 转膜结束后将膜用TBST洗1次,10 min,倒掉TBST; 4) 用含5%脱脂奶粉的TBST封闭,室温下低速摇床上封闭1 h; 5) 用含5%脱脂奶粉的封闭液稀释一抗,膜室温下低速摇床上杂交4 h; 6) TBST洗膜3次,每次10 min:
7) 用含5%脱脂奶粉的封闭液稀释二抗,膜室温下低速摇床上杂交45 min; 8) ECL曝光后上机扫膜。
2.结果与分析
2.1 蛋白可行性分析
为了初步分析所选蛋白是否可用于酵母外泌系统表达,我们通过信号肽预测、N糖基
化预测和三维结构预测,发现X基因都不含有信号肽,并且C端是裸露的,所以打算把His标签添加至C端。无糖基化位点,三维结构为单体(表1)
表1 四个蛋白可行性分析
基因名称 氨基酸蛋白预测同源性单体/末端暴5.0信4.0信糖基化 数量 名称 分数 聚体 露 号肽 号肽 位点数量 X --aa 类甜蛋白 65.5% 单体 C端暴无信号无信号0 露 肽 肽 2.2 蛋白表达鉴定
为了确定蛋白是否表达,进行WB检测。结果如图1所示。
图1 WB检测
WB检测蛋白表达情况,M:Maker; 1: X第四次加甲醇;2:第五次加甲醇; 3:His对照。
结论:X蛋白可以表达。