绵羊Lpin2基因CDS区克隆与生物信息学分析
焦小丽1,2,景炅婕1,乔利英1,李留安2,李宝钧1,刘文忠1*
【摘 要】本研究应用RT-PCR、5'-RACE、TA克隆技术获得绵羊Lpin2基因CDS区,并进行相关生物信息学分析,为其遗传特性及编码蛋白功能机制的研究提供基础数据。结果获得绵羊Lpin2基因2 754 bp,包括84 bp的5'UTR和2 670 bp的CDS区,编码889个氨基酸。生物信息学分析编码蛋白lipin2属不稳定的中性亲水脂溶性蛋白,存在跨膜域、2个O-糖基化位点和89个磷酸化位点,没有信号肽,定位于细胞质或细胞器中。存在由细胞质活性氧(ROS)主导的氧化还原机制形成的二硫键。二级结构包含高比例的环(80.54%)。蛋白N-末端和C-末端分别含有保守结构域Lipin_N和LSN2。绵羊与山羊、家牛、羊驼、猪、家犬、灵长类与啮齿类动物以及原鸡lipin2氨基酸序列同源,系统进化与其亲缘关系远近一致, Lpin2基因编码区进化保守。绵羊lipin2与lipin1氨基酸序列相似性相对较低(66%),可能与其有差异的功能活性有关。 【期刊名称】中国畜牧杂志 【年(卷),期】2017(053)004 【总页数】7
【关键词】绵羊;Lpin2基因;克隆;生物信息学
脂素(Lipins)是双向调控脂肪代谢的关键调控蛋白,在脂质代谢中具有Mg2+离子依赖的磷脂酸磷酸酶(PAP)活性,催化磷脂酸(PA)生成甘油二酯(DAG),还可作为转录共激活因子调控脂质相关基因的表达[1,2],其编码基因突变可导致脂质稳态及代谢异常[3],哺乳动物lipins家族蛋白由lipin1、lipin2与lipin3 3个成员组成,分别被Lpin1、Lpin2与Lpin3基因编码[1]。2个相近的蛋白