胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究
陈菊祥;卢亦成;胡国汉;骆纯;楼美清;应康;李瑶;谢毅
【期刊名称】《中华神经外科疾病研究杂志》 【年(卷),期】2004(003)003
【摘要】目的探讨人脑胶质母细胞瘤发生、发展中相关基因的表达及功能.方法用含13 939种人类基因的BioStarH140S型表达谱芯片,以正常成人脑及不同级别胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片;ScanArray 4000扫描芯片荧光信号,提取脑及胶质瘤组织差异基因并进行生物信息分析;用Hierarchical聚类对胶质瘤差异基因进行特征提取;用Northern杂交验证及进行初步功能研究.结果正常脑与18例不同级别胶质瘤组织间筛选出多类差异表达基因,通过生物信息学和Hierarchical聚类,发现α-连环素、微型染色体维护蛋白7、细胞周期素B2、FBX05、着丝粒蛋白F基因与胶质母细胞瘤密切相关,该类基因在低级别胶质瘤中表达差异不明显,但胶质母细胞瘤中表达明显上调.Northern杂交显示该类基因与胶质母细胞瘤密切相关,与芯片结果一致.结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选胶质瘤相关基因,发现的5条基因与胶质母细胞瘤侵袭性强密切相关,可成为判断胶质瘤预后的分子生物学指标. 【总页数】4页(222-225)
【关键词】脑胶质母细胞瘤;基因芯片;表达谱;Hierarchical聚类 【作者】陈菊祥;卢亦成;胡国汉;骆纯;楼美清;应康;李瑶;谢毅
【作者单位】第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上海,200003;第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上海,200003;第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上
海,200003;第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上海,200003;第二军医大学附属长征医院神经外科,上海市神经外科研究所,上海,200003;复旦大学生命科学学院遗传学研究所,上海,200433;复旦大学生命科学学院遗传学研究所,上海,200433;复旦大学生命科学学院遗传学研究所,上海,200433 【正文语种】中文 【中图分类】R739.4 【相关文献】
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3.运用低密度表达谱芯片检测原发胶质母细胞瘤中相关基因表达 [J], 杨柳松; 胡锦; 周良辅; 邵敏华; 卢大儒
4.利用基因芯片研究与胶质母细胞瘤侵袭性相关的基因 [J], 陈菊祥; 卢亦成; 骆纯; 胡国汉; 楼美清; 吴小军; 李瑶; 应康
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胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究
