将凝胶置于电泳槽,加入1×TAE电泳缓冲液覆盖胶面即可。各取PCR产物和DNA分子量参照物10 μl DNA加入1μl 6×loading buffer,混合后上样,分不加入琼脂糖凝胶孔内。加样时切勿破坏点样孔周围的凝胶。
3. 电泳:
合上电泳槽盖,打开电泳仪,操纵电压保持在60-80V,电流在40mA 以上。当溴酚蓝条带移动到距凝胶前沿约2cm 时,停止电泳。
4. 染色:
未加EB 的胶板在电泳完毕后移入0.5μg/ml 的EB 溶液中,室温下染色20-25 分钟。
5. 观看和拍照:
电泳完成后切断电源,取出凝胶,置于凝胶成像分析仪上观看电泳结果,并照相记录。或在波长为254 nm的紫外灯下观看DNA的荧光条带。紫光灯下观看时应戴上防护眼镜或有机玻璃面罩,以免损害眼睛。
【注意事项】
1.阻碍DNA在琼脂糖凝胶中迁移速率的因素:
(1)DNA大小:迁移速率与log N成反比(N为碱基对数目)。分子越大,迁移越慢。分子量相同的空间结构越紧密的电泳越快,如超螺旋>线性DNA。
(2)琼脂糖凝胶浓度:不同的凝胶浓度,辨论不同范畴的DNA :
琼脂糖凝胶浓度 0.5% 0.7% 可辨论的线性DNA片段大小(kb) 5-60 0.8-12 1.0% 1.5% 1.75% 2.0% 0.4-6 0.2-4 0.2-3 0.1-3 (3)DNA构象:一样迁移速率超螺旋环状 > 线状DNA > 单链开环。当条件变化时,情形会相反,还与琼脂糖的浓度、电流强度、离子强度及EB含量有关。
(4)所加电压:低电压时,线状DNA片段的迁移速率与所加电压成正比。使辨论成效好,凝胶上所加电压不应超过20V/cm,电泳温度应该低于30℃。
(5)嵌入染料的存在:降低线性DNA迁移率(不提倡加在电泳液中)。
(6)电泳缓冲液(0.5×TBE)的组成及其离子强度阻碍DNA的迁移率。无离子存在时,核酸差不多不泳动;离子强度过大产热厉害,熔化凝胶并导致DNA变性。一样采纳1×TAE,1×TBE,1×TPE(均含EDTA pH8.0)。
2.溴化乙锭(EB)为致癌剂,操作时应戴手套,尽量减少台面污染,凡是沾污了EB 的容器或物品必须经专门处理后才能清洗或丢弃。
3.电泳指示剂:核酸电泳常用的指示剂有两种,溴酚蓝(bromophenol blue, Bb)呈蓝紫色;二甲苯晴(xylene cyanol, Xc)呈蓝色,它携带的电荷量比溴酚蓝少,在凝胶中的的迁移率比溴酚蓝慢。
【实验结果与分析】
1.电泳过程中,你自己或本组所采纳的电压为________伏特(v),电流为_______毫安(mA),通电时刻为_______分钟。
2.在实验报告上描画自己或实验组的电泳图谱,标明阳极和阴极位置。
【摸索题】
你的电泳结果如何?成功或失败有哪些方面的缘故?进行琼脂糖凝胶电泳时应注意哪些咨询题?