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关于BCCIP与P53相互作用的研究

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关于BCCIP与P53相互作用的研究

作者:刘昱彤

来源:《科技风》2020年第14期

摘;要:BCCIP是一个与BRCA2和p21相互作用的蛋白质,在众多细胞进程中具有重要作用。p53是一种重要的肿瘤抑制基因,也是迄今发现与人类肿瘤相关性最高的基因。本文通过引入P53基因来研究BCCIP抑制肿瘤的生物学功能,验证BCCIP与P53之间的蛋白相互作用关系。

关键词:转录调控;BCCIP;P53;抑癌基因;蛋白质与蛋白质相互作用;表观遗传学

BCCIP是一个与BRCA2和p21相互作用的蛋白质。作为一种新近克隆成功的抑癌基因,BCCIP是细胞生存、基因稳定不可缺少的基因,该蛋白在胚胎发育、细胞周期调控、细胞有丝分裂、DNA同源重组(HR)以及保持基因组稳定性等众多细胞进程中都具有重要作用[1]。截至到目前的研究,在Bio GRID数据库记录的BCCIP相互作用蛋白有50多种,功能涉及多种细胞生物学过程,预示着BCCIP蛋白在更多方面的功能还有待进一步研究。有研究表明,BCCIP基因在乳腺癌、脑神经胶质瘤、喉癌、肺癌、黑色素瘤、肾癌、前列腺癌等组织中的表达量均有降低或不表达[2],提示BCCIP与这些肿瘤的发生相关,也进一步证实了BCCIP可能为一个重要的抑癌基因。

为了进一步探讨BCCIP的功能和作用机制,我们将研究BCCIP与P53之间相互作用的关键性结构域以揭示BCCIP在肿瘤中发挥的功能。因此,我们引入P53基因来研究BCCIP抑制肿瘤的生物学功能。已有研究证实,BCCIP通过调节p53的转录活性,减少p53四聚体的形成,阻止p53与它的靶基因p21和HDM2的增强子结合。目前P53对P21的调控作用已有充分的研究,我们将着重研究BCCIP对P53的调控作用。在前期数据的基础上,为了进一步阐明BCCIP与P53之间的蛋白相互作用位点,本文拟设计实验:构建BCCIP的真核和原核的表达载体,通过Co-IP和GST pull down等技术找出BCCIP与P53相结合的具体结构域。 1 材料与设备 1.1 实验材料 1.1.1 主要化学试剂

乙二胺四乙酸二钠(EDTA)、质粒小提试剂盒、琼脂糖凝胶回DNA收试剂盒、丙烯酰胺、Tris、甘氨酸、十二烷基磺酸钠(SDS)、D2000 plus DNA ladder、DL500 DNA marker、預染蛋白Marker SM0671、胎牛血清。

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1.1.2 常用试剂成分

(1)LB液体培养基(1L):10g NaCl,5g酵母提取物,10g胰蛋白胨,调pH至7.4,高压蒸汽灭菌。

(2)LB固体培养基(1L):LB液体培养基中加入15g琼脂粉。

(3)SOC培养基(1L):20g胰蛋白胨,5g酵母提取物,2ml 5M NaCl,2.5ml 1M KCl,10ml 1M MgCl2,10ml 1M MgSO4,20ml 1M葡萄糖。

(4)Amp抗生素:1克Amp,10ml蒸馏水,浓度100mg/ml。

(5)DMEM培养基(1L):一包粉末DMEM培养基,800ml水,2g NaHCO3,10%血清。

(6)磷酸缓冲体系(PBS)(1L):NaCl 137mmol/L,KCl 27mmol/L,Na2HPO4 10mmol/L,KH2PO4 2mmol/L。用浓盐酸调pH为7.4。 (7)胰酶:0.25g胰酶,100mlPBS,调PH为7.4。

(8)50×TAE buffer(1L):Tris 242g,冰乙酸57.1ml,0.5mol/L EDTA(pH 8.0)100ml。

(9)6×loading buffer(DNA电泳):30mM EDTA,36%(V/V)甘油。 (10)10×湿转transfer buffer(1L):Tris 14.4g、甘氨酸3.02g、甲醇100ml。 (11)4×SDS-PAGE Loading Buffer(1L):量取1M Tris-HCl 10ml,称取4g SDS,200mgBPB,20ml甘油。

(12)PBS(1L):1ml双抗+999ml PBS。 1.2 实验设备

低温保存箱、药品保存箱、-80℃冰箱、-40℃冰箱、PCR仪、恒温卧式摇床、紫外分光光度计、超声破碎仪、凝胶成像系统、电泳仪电源、水平电泳槽、迷你离心机、超净工作台、垂直混合器、低速离心机、可见光分析灯箱、恒温培养箱、双垂直蛋白电泳仪、台式离心机、电子天平、涡旋混匀器、琼脂糖凝胶电泳仪、洗片机、超纯水机、制冰机、磁力搅拌器、脱色摇床。

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2 实验思路与方法 2.1 实验研究思路

首先我们根据BCCIP和P53的蛋白结构域特征,分别构建了BCCIP和P53的不同截短真核表达质粒,然后在HCT116细胞中共转BCCIP和P53的不同截短质粒,通过COIP实验和免疫印迹检测技术,确定BCCIP与P53相互作用的具体结构域。而后在HCT116细胞中瞬转一定量的P53全长表达质粒和梯度剂量的BCCIP全长表达质粒,通过Western blot检测BCCIP对P53蛋白的稳定性的影响;再用同样的方法瞬转不同的截短表达质粒,检测BCCIP对P53相互作用结构域的稳定性影响,进而揭示BCCIP对P53的调控以及在癌症中的生物学功能。 2.2 实验研究方法 2.2.1 质粒构建

(1)设计BCCIP和P53的截短质粒引物,PCR选择最佳退火温度。(2)DNA电泳并做胶回收。(3)目的片段连接T载体。(4)大肠杆菌转化,蓝白斑筛选,挑菌。(5)PCR检测,选择电泳条带正确的菌株进行小提。(6)送公司进行测序。(7)将连T的Insert和载体分别进行大切胶回收(先小切进行验证)。(8)Insert与Vector连接。(9)质粒转化,挑菌。(10)菌液PCR选取条带位置正确的菌液进行小提。(11)送公司进行测序。 2.2.2 真核表达质粒Co-IP实验

(1)在HCT116細胞中共转BCCIP和P53的表达质粒。(2)瞬转48小时后收细胞,RIPA裂解液4度裂解6小时。(3)12000rpm,4度,离心1小时,收集裂解后上清。(4)平衡beads,beads与细胞裂解液孵育过夜进行结合。(5)洗脱非特异蛋白,做样,western blot检测。

3 实验结果分析

在细胞周期调控中,目前发现BCCIP通过3个途径调节p21蛋白;在同源重组修复中,BCCIP除了通过BRCA2-RAD51蛋白通路外,还可能通过p21蛋白参与细胞周期和细胞周期检查点的调节进而影响同源重组修复[3];在维持基因组稳定性方面,BCCIP下调引起细胞分裂中期染色体断裂和姐妹染色单体交联,从而影响细胞的有丝分裂,抑制细胞的增值。 One等[4]发现BCCIPα的161-259氨基酸区域与p21的C端149~164氨基酸和CDK2结合后形成三聚体。BCCIPα的过表达通过增强p21抑制CDK2组蛋白H1激酶活性的能力以达到抑制细胞增殖的目的。Meng等[5]发现在细胞内BCCIPβ与p21相互作用可以抑制细胞的生长,并且p21蛋白下调的细胞阻断部分其抑制细胞生长的功能。用RNA干扰技术抑制BCCIP

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