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过表达慢病毒载体构建和包装手册 version1 - 图文

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7) 倒出培养液,将管倒置1分钟,使最后残留的痕量培养液流尽。

8) 每50 ml初始培养物用2 ml用冰预冷的0.1 mol/L CaCl2重悬每份细胞沉淀。 9) 将细胞分装成小份,放于-70oC冻存。

(感受态细胞制备参考:分子克隆实验指南第二版55页)

1.3.3 转化:

1) 用冷却的无菌吸头从每种感受态细胞悬液中各取200 μL转移到无菌的微量离心管中,每

管加10 μL 连接液,轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30分钟。

2) 将管放到预加温到42℃的循环水浴中放好的EP管架上,恰恰放置90秒,不要摇动EP管

架。

3) 快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却l—2分钟。

4) 每管加800 μL LB培养基。用水浴将培养基加温至37℃,然后将管转移到37℃摇床上,

温育45分钟使细菌复苏。

5) 将150 μL已转化的感受态细胞转移到AMP抗性(100ug/ml)的 LB琼脂培养基上。 6) 将平板置于室温直至液体被吸收。 7) 倒置平皿,于37℃培养,16小时。 8) 长出的克隆进行后续PCR鉴定。

(转化操作参考:分子克隆实验指南第二版55-56页)

1.4 阳性克隆的PCR鉴定 1.4.1 引物

ID Stk39-SEQF EGFP-N-R seq CGGTGAATGCTGGTGGCATC TCACCATGGTGGCGACCGGGCTCACACTCAACTGGGC 11/ 33

引物说明:本对引物一个位于目的基因中,一个位于载体上,用于菌落PCR鉴定转化子

1.4.2 PCR鉴定

PCR反应体系:

试剂 体积(μL) ddH2O 5×Taq buffer dNTPs (2.5mM) Primer(+)(10μM) Primer(-)(10μM) Template Taq polymerase PCR反应条件:

12.4 4 1.6 0.4 0.4 1 0.2 94℃ 3 min 94℃ 30 sec 60℃ 30 sec 72℃ 30 sec 72℃ 5 min 4℃ ∞

30 cycle

1.4.3 PCR结果

PCR产物电泳图 12/ 33

1 2 3 4 5 6 7 8

样品说明:

泳道 1# 2# 3# 4# 样品编号 阴性对照(ddH2O) 阴性对照(空载自连对照组) 阳性对照(GAPDH) Marker:5 kb,3 kb,2 kb,1.5 kb,1 Kb,750 bp,500 bp,250 bp,100 bp 5# ~8# Stk39-1~4号转化子 接种阳性转化子,37℃培养16小时后保存为甘油菌,分装200μL送测序

1.5 阳性克隆测序结果及结果分析:

>ref|NM_016866.2| homolog (yeast) (Stk39), mRNA

Mus musculus serine/threonine kinase 39, STE20/SPS1

gb|BC064443.1| Mus musculus serine/threonine kinase 39, STE20/SPS1 homolog (yeast),

mRNA (cDNA clone MGC:69607 IMAGE:6843981), complete cds

Length=3268

13/ 33

GENE ID: 53416 Stk39 | serine/threonine kinase 39, STE20/SPS1 homolog (yeast) [Mus musculus] (Over 10 PubMed links)

Score = 3083 bits (1669), Expect = 0.0

Identities = 1669/1669 (100%), Gaps = 0/1669 (0%) Strand=Plus/Plus

Query 84 CATGGCGGAGCCGAGCGGCTCGCCTGTGCACGTCCAGCTTTCCCAGCAggcggccccggt 143 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 104 CATGGCGGAGCCGAGCGGCTCGCCTGTGCACGTCCAGCTTTCCCAGCAGGCGGCCCCGGT 163

Query 144 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 164 GACAGCGGCGGCGGCGACGGCCCCGGCGGCCGCGACATCAGCACCAGCCCCGGCCCCGGC 223

Query 204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 224 CCCGGCTCCGGCGGCGTCCGCAGCCCCGGCCCCGGCTCCAGCTGCTGCTCCAGCCCCGGC 283

Query 264 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 284 CCCGGCAGCTCAGGCGGTCGGCTGGCCCATCTGCAGGGACGCGTACGAGCTCCAGGAGGT 343

Query 324 TATCGGCAGCGGAGCAACTGCGGTGGTTCAGGCAGCCCTATGCAAACCCAGGCAAGAACG 383 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 344 TATCGGCAGCGGAGCAACTGCGGTGGTTCAGGCAGCCCTATGCAAACCCAGGCAAGAACG 403

Query 384 CGTAGCCATAAAGCGGATCAACTTGGAAAAATGCCAGACGAGTATGGATGAACTCCTGAA 443 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 404 CGTAGCCATAAAGCGGATCAACTTGGAAAAATGCCAGACGAGTATGGATGAACTCCTGAA 463

Query 444 AGAAATTCAAGCCATGAGCCAATGCAGCCATCCCAACGTAGTGACTTATTACACCTCCTT 503 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 464 AGAAATTCAAGCCATGAGCCAATGCAGCCATCCCAACGTAGTGACTTATTACACCTCCTT 523

Query 504 TGTGGTCAAAGATGAGCTGTGGCTGGTCATGAAATTACTAAGTGGAGGTTCCATGTTGGA 563 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 524 TGTGGTCAAAGATGAGCTGTGGCTGGTCATGAAATTACTAAGTGGAGGTTCCATGTTGGA 583

Query 564 TATCATCAAATACATCGTTAATCGAGGAGAACATAAAAATGGTGTCCTAGAAGAGGCGAT 623 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 584 TATCATCAAATACATCGTTAATCGAGGAGAACATAAAAATGGTGTCCTAGAAGAGGCGAT 643

gacagcggcggcggcgacggccccggcggccgcgacatcagcaccagccccggccccggccccggctccggcggcgtccgcagccccggccccggctccagctgctgctccagccccggccccGGCAGCTCAGGCGGTCGGCTGGCCCATCTGCAGGGACGCGTACGAGCTCCAGGAGGT 323 14/ 33

203 263 Query 624 AATTGCAACAATTCTTAAGGAGGTTTTGGAAGGTTTAGACTATCTGCACAGAAACGGTCA 683 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 644 AATTGCAACAATTCTTAAGGAGGTTTTGGAAGGTTTAGACTATCTGCACAGAAACGGTCA 703

Query 684 GATCCATAGGGATTTGAAAGCTGGAAATATTCTTCTGGGTGAGGATGGCTCAGTACAAAT 743 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 704 GATCCATAGGGATTTGAAAGCTGGAAATATTCTTCTGGGTGAGGATGGCTCAGTACAAAT 763

Query 744 AGCAGATTTTGGAGTAAGCGCATTCTTAGCCACAGGGGGTGATGTTACACGGAATAAAGT 803 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 764 AGCAGATTTTGGAGTAAGCGCATTCTTAGCCACAGGGGGTGATGTTACACGGAATAAAGT 823

Query 804 CAGAAAAACATTTGTTGGTACCCCATGTTGGATGGCCCCTGAAGTCATGGAACAGGTGAG 863 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 824 CAGAAAAACATTTGTTGGTACCCCATGTTGGATGGCCCCTGAAGTCATGGAACAGGTGAG 883

Query 864 AGGCTATGACTTCAAGGCTGATATGTGGAGTTTTGGAATAACTGCCATTGAATTAGCAAC 923 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 884 AGGCTATGACTTCAAGGCTGATATGTGGAGTTTTGGAATAACTGCCATTGAATTAGCAAC 943

Query 924 CGGAGCAGCGCCTTACCACAAATACCCTCCAATGAAAGTGCTAATGCTGACTTTGCAAAA 983 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 944 CGGAGCAGCGCCTTACCACAAATACCCTCCAATGAAAGTGCTAATGCTGACTTTGCAAAA 1003

Query 984 TGACCCGCCCACTTTAGAAACTGGTGTAGAGGATAAAGAAATGATGAAAAAATACGGCAA 1043 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 1004 TGACCCGCCCACTTTAGAAACTGGTGTAGAGGATAAAGAAATGATGAAAAAATACGGCAA 1063

Query 1044 GTCCTTCAGAAAGTTACTGTCACTGTGTCTTCAGAAAGATCCTTCCAAAAGGCCCACAGC 1103 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 1064 GTCCTTCAGAAAGTTACTGTCACTGTGTCTTCAGAAAGATCCTTCCAAAAGGCCCACAGC 1123

Query 1104 AGCAGAACTTTTAAAATGCAAGTTCTTCCAGAAAGCCAAGAACAGAGAGTACCTGATCGA 1163 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 1124 AGCAGAACTTTTAAAATGCAAGTTCTTCCAGAAAGCCAAGAACAGAGAGTACCTGATCGA 1183

Query 1164 GAAGCTGCTGACAAGAACCCCAGACATAGCCCAAAGAGCCAAGAAGGTAAGGCGAGTTCC 1223 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 1184 GAAGCTGCTGACAAGAACCCCAGACATAGCCCAAAGAGCCAAGAAGGTAAGGCGAGTTCC 1243

Query 1224 TGGGTCGAGCGGTCACCTTCATAAGACTGAAGACGGCGACTGGGAGTGGAGCGATGACGA 1283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||

Sbjct 1244 TGGGTCGAGCGGTCACCTTCATAAGACTGAAGACGGCGACTGGGAGTGGAGCGATGACGA 1303

15/ 33

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