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酵母信号肽跟踪筛选技术

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技术简介

采用酵母信号肽筛选(yeast signal peptide screen,YSST)验证信号肽的分泌功能。试验中选用的酵母菌株为缺失蔗糖转化酶基因、在以蔗糖为唯一碳源的培养基上不能生长的YTK12。选用的载体质粒为含有色氨酸合成基因和一个缺失信号肽与起始密码子ATG 的蔗糖转化酶基因(SUC2)的pSUC2。当一个具有功能的信号肽连接到pSUC2的蔗糖转化酶基因之前时可以恢复蔗糖转化酶的分泌功能,从而使YTK12菌株可在以棉子糖为碳源的缺陷型培养基上生长。此外,TTC显色反应也常用于验证结果。

实验方案

1. 通过SignalP预测候选分泌蛋白的信号肽区域,设计引物,构建到pSUC2载体上,载体

抗性为氨苄抗性。

2. YTK12菌株在YPDA培养上划线培养,将构建好的相应载体导入YTK12,涂布在CMD-W(缺色氨基酸)培养基平板上,培养。

3. 挑取阳性克隆到棉子糖为碳源的YPRAA培养基上,培养。如果转接后的酵母细胞在

YPRAA培养基上能够生长,那么就证明信号肽具有分泌功能;如果不能生长,则证明信号肽无分泌功能。

4. 将上述步骤中的阳性转化株用CMD-W培养液培养,收集细胞悬浮液离心去上清,将沉

淀用重悬液重悬,37℃孵育10 min。离心后取上清液加入TTC于试管中,以未转化的YTK12酵母菌作为对照,观察颜色变化情况照相记录。如果颜色变红,证明信号肽具有分泌功能。

实验结果

酵母信号肽跟踪系统验证信号肽分泌活性 (Xu et al., Nat. Commun., 2019)

参考文献

1.

Xu Q, Tang C, Wang X, Sun S, Zhao J, Kang Z, Wang X. (2019). An effector protein of the wheat stripe rust fungus targets chloroplasts and suppresses chloroplast function. Nat Commun 10, 5571. 2.

Yin W, Wang Y, Chen T, Lin Y, Luo C. (2018). Functional evaluation of the signal peptides of secreted proteins. Bio-protocol 8(9): e2839. DOI: 10.21769/BioProtoc.2839.

南京瑞源生物技术有限公司坐落于南京市栖霞区生命科技园,专注于基因组高通量研究领域,致力于生物高科技研发,目前产品的技术水平已达到省级实验水平,瑞源生物立足于生命科学,为基础研究领域科学工作者提供生物学技术服务,自2019年创立以来,全体员工致力于利用酵母系统研发新药物靶点,专注于生物学研究,长期与全国各大农林/医药院校在大型科研技术研发上紧密合作。

酵母信号肽跟踪筛选技术

技术简介采用酵母信号肽筛选(yeastsignalpeptidescreen,YSST)验证信号肽的分泌功能。试验中选用的酵母菌株为缺失蔗糖转化酶基因、在以蔗糖为唯一碳源的培养基上不能生长的YTK12。选用的载体质粒为含有色氨酸合成基因和一个缺失信号肽与起始密码子ATG的蔗糖转化酶基因(SUC2)的pSUC2。当一个具有功能的信号肽连接到pSUC2的蔗
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