(2)推导出编码正常肽段和突变体肽段的核苷酸序列. 提示:有关氨基酸的简并密码分别为
Val: GUU GUC GUA GUG Arg: CGU CGC CGA CG AGA AGG Cys: UGU UGC Ala: GCU GCC GCA CGC 提示:(1)在正常肽段的第一个Val的密码GUA的G后插入了一个C ;(2) 正常肽段的核苷酸序列为:AUG GUA UGC GU… CG…;突变体肽段的核苷酸序列为:AUG GCU AUG CGU 。 14. 试列表比较核酸与蛋白质的结构。 核酸(Nucleic acids) DNA 一级结构 Primary structure 二级结构 Secondarystructure 三级结构 Tertiary structure RNA 氨基酸排列顺序 肽键 核苷酸序列 AGTTCT 或AGUUCU 的排列顺序 3,,5,- 磷酸二酯键 双螺旋 主要是氢键,碱基堆积力 超螺旋 蛋白质(Proteins) 配对(茎-环结构) 有规则重复的构象 (同左) (α-helix ,β- sheet,β-turn) 氢键 RNA空间构象 一条肽链的空间构象 范德华力 氢键 疏水作用 盐桥 二硫键等 多条肽链 (或不同蛋白) 四级结构 Quaternarystructure 15. 试比较原核生物与真核生物的翻译。 原核生物与真核生物的翻译比较如下:仅述真核生物的,原核生物与此相反。 (1).起始Met不需甲酰化;(2).无SD序列,但需要一个扫描过程;(3).tRNA先于mRNA与核糖体小亚基结合;(4).起始因子比较多;(5).只一个终止释放因子。
(三)填空题
1.蛋白质的生物合成是以__ mRNA 为模板,以__ 氨酰-tRNA __为原料直接供体,以__核糖体_____为合成杨所。
2.生物界共有_____64____个密码子,其中____61___个为氨基酸编码,起始密码子为___AUG ______;终止密码子为___ UAA _、___ UAG _、__ UGA___。
3.原核生物的起始tRNA以____ tRNAf ____表示,真核生物的起始tRNA以____ tRNAi ___表示,延伸中的甲硫氨酰tRNA以___ tRNAm __表示。
4.植物细胞中蛋白质生物合成可在____核糖体____、____线粒体____和____叶绿体_______三种细胞器内进行。
5.延长因子T由Tu和Ts两个亚基组成,Tu为对热___不稳定___蛋白质,Ts为对热__ 稳定_蛋白质。 6.原核生物中的释放因子有三种,其中RF-1识别终止密码子_____UAA________、____UAG________;RF-2识别_____UAA_____、_____UGA_______;真核中的释放因子只有____RF_______一种。 7.氨酰-tRNA合成酶对___氨基酸_______和相应的__tRNA______有高度的选择性。
8.原核细胞的起始氨基酸是__甲酰甲硫氨酸___,起始氨酰-tRNA是___甲酰甲硫氨酰-tRNA___。 9.原核细胞核糖体的____小___亚基上的 ___16SrRNA_______协助辨认起始密码子。 l0.每形成一个肽键要消耗____4____个高能磷酸键,但在合成起始时还需多消耗____1____个高能磷酸键。 11.肽基转移酶在蛋白质生物合成中的作用是催化___肽键_______形成和___ 肽酰-tRNA ______的水解。 12.肽链合成终止时,__终止因子_________进人“A”位,识别出___终止密码子______,同时终止因子使__肽基转移酶______的催化作用转变为___水解作用_________。
13.原核生物的核糖体由_____30S_______小亚基和____50S________大亚基组成,真核生物核糖体由___40S______小亚基和_______60S________大亚基组成。
14. 蛋白质中可进行磷酸化修饰的氨基酸残基主要为_____Ser______、____Thr_______、___Tyr_______。
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(四)选择题
1.蛋白质生物合成的方向是( ④ )。
①从C→N端 ②定点双向进行 ③从N端、C端同时进行 ④从N→C端 2.不能合成蛋白质的细胞器是( ③ )。
①线粒体 ②叶绿体 ③高尔基体 ④核糖体 3.真核生物的延伸因子是( ④ )。
①EF—Tu ②EF一2 ③EF--G ④EF一1 4.真核生物的释放因子是( ① )。
①RF ②RF一1 ③RF一2 ④RF一3
5.能与tRNA反密码子中的I碱基配对的是( ④ )。 ①A、G ②C、U ③U ④U、C、A 6.蛋白质合成所需能量来自( ③ )。 ①ATP ②GTP ③ATP、GTP ④GTP 7.tRNA的作用是( ② )。
①将一个氨基酸连接到另一个氨基酸上 ②把氨基酸带到mRNA位置上 ③将mRNA接到核糖体上 ④增加氨基酸的有效浓度 8.关于核糖体的移位,叙述正确的是( ③ )。
①空载tRNA的脱落发生在“A”位上 ②核糖体沿mRNA的3’→5’方向相对移动 ③核糖体沿mRNA的5’→3’方向相对移动
④核糖体在mRNA上一次移动的距离相当于二个核苷酸的长度 9.在蛋白质合成中,下列哪一步不需要消耗高能磷酸键( ① )。 ①肽基转移酶形成肽键 ②氨酰一tRNA与核糖体的“A,’位点结合 ③核糖体沿mRNA移动
④fMet—tRNAf与mRNA的起始密码子结合以及与大、小亚基的结合 10.在真核细胞中肽链合成的终止原因是( ④ )。
①已达到mRNA分子的尽头 ②具有特异的tRNA识别终止密码子 ③终止密码子本身具有酯酶作用,可水解肽酰与tRNA之是的酯键 ④终止密码子被终止因子(RF)所识别
11.蛋白质生物合成中的终止密码是( ①④⑤ )。 ①UAA ②UAU ③UAC ④UAG ⑤UGA
12.根据摆动假说,当tRNA反密码子第1位碱基是I时,能够识别哪几种密码子( ①②⑤ ) ①A ②C ③G ④T ⑤U
13.下列哪些因子是真核生物蛋白质合成的起始因子( ③④⑤ )。 ①IF1 ②IF2 ③eIF2 ④eIF4 ⑤elF4A
14.蛋白质生物合成具有下列哪些特征( ①②③⑤ )。
①氨基酸必须活化 ②需要消耗能量 ③每延长一个氨基酸必须经过进位、转肽、移位、税落四个步骤 ④合成肽链由C端向N端不断延长 ⑤新生肽链需加工才能成为活性蛋白质 15.下列哪些内容属于蛋白质合成后的加工、修饰( ②③④⑤ )。
①切除内含子,连接外显子 ②切除信号肽 ③切除N-端Met ④形成二硫键 ⑤氨的侧链修饰
16.蛋白质生物合成过程中,下列哪些步骤需要消耗能量( ①②③⑤ )。
①氨基酸分子的活化 ②70S起始复合物的形成 ③氨酰tRNA进入核糖体A位 ④肽键形成 ⑤核糖体移位
17.原核生物的肽链延伸过程有下列哪些物质参与( ①②③⑤ )。
①肽基转移酶 ②鸟苷三磷酸 ③mRNA ④甲酰甲硫氨酰-tRNA ⑤EF-Tu、EF-Ts、 EF-G
18.Shine-Dalgarno顺序(SD-顺序)是指: ( ① )
①在mRNA分子的起始码上游8-13个核苷酸处的顺序 ②在DNA分子上转录起始点前8-13个核苷酸处的顺序
③16srRNA3'端富含嘧啶的互补顺序 ④启动基因的顺序特征 ⑤以上都正确
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19. 在研究蛋白合成中,可利用嘌呤霉素,这是因为它: ( ② )
①使大小亚基解聚 ②使肽链提前释放 ③抑制氨基酰-tRNA合成酶活性 ④防止多核糖体形成 ⑤以上都正确
20. 氨基酸活化酶:( ④ )
①活化氨基酸的氨基 ②利用GTP作为活化氨基酸的能量来源 ③催化在tRNA的5’磷酸与相应氨基酸间形成酯键
④每一种酶特异地作用于一种氨基酸及相应的tRNA ⑤以上都不正确 (五)是非题
1.DNA不仅决定遗传性状,而且还直接表现遗传性状。( × ) 2.密码子在mRNA上的阅读方向为5’→ 3’。( √ ) 3.每—种氨基酸都有两种以上密码子。( × ) 4.一种tRNA只能识别一种密码子。( × )
5.线粒体和叶绿体的核糖体的亚基组成与原核生物类似。( √ )
6.大肠杆菌的核糖体的小亚基必须在大亚基存在时,才能与mRNA结合。( × ) 7.大肠杆菌的核糖体的大亚基必须在小亚存在时,才能与mRNA结合。( √ ) 8.在大肠杆菌中,一种氨基酸只对应于一种氨酰-tRNA合成酶。( √ )
9.氨基酸活化时,在氨酰-tRNA合成酶的催化下,由ATP供能,消耗—个高能磷酸键。( × ) 10.线粒体和叶绿体内的蛋白质生物合成起始与原核生物相同。( √ ) 11.每种氨基酸只能有一种特定的tRNA与之对应。( × )
12.AUG既可作为fMet-tRNAf和Met-tRNAi的密码子,又可作为肽链内部Met的密码子。( √ ) 13.构成密码子和反密码子的碱基都只是A、U、C、G。( × ) 14.核糖体大小亚基的结合和分离与Mg2+,的浓度有关。( √ ) 15.核糖体的活性中心“A”位和“P”位都主要在大亚基上。( × ) 16. E.coli中,DnaA与复制起始区DNA结合,决定复制的起始。( √ )
核酸的生物合成 (一)名词解释
1.中心法则(central dogma):生物体遗传信息流动途径。最初由Crick(1958)提出,经后人的不断补充和修改,现包括反转录和RNA复制等内容。
2.半保留复制(简称复制)(semiconservative replication):亲代双链DNA以每条链为模板,按碱基配对原则各合成一条互补链,这样一条亲代DNA双螺旋,形成两条完全相同的子代DNA螺旋,子代DNA分子中都有一条合成的“新”链和一条来自亲代的旧链,称为半保留复制。
3.DNA聚合酶(DNA polymerase):指以脱氧核苷三磷酸为底物,按5’→ 3’方向合成DNA的一类酶,反应条件:4种脱氧核苷三磷酸、Mg+、模板、引物。DNA聚合酶是多功能酶,除具有聚合作用外,还具有其它功能,不同DNA聚合酶所具有的功能不同。
4.解旋酶(helicase):是一类通过水解ATP提供能量,使DNA双螺旋两条链分开的酶,每解开一对碱基,水解2分子ATP。
5.拓扑异构酶(topoisomerase):是一类引起DNA拓扑异构反应的酶,分为两类:类型I的酶能使DNA的一条链发生断裂和再连接,反应无需供给能量,类型Ⅱ的酶能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入超螺旋时,需要由ATP供给能量。
6.单链DNA结合蛋白(single-strand binding protein ,SSB):是一类特异性和单链区DNA结合的蛋白质。它的功能在于稳定DNA解开的单链,阻止复性和保护单链部分不被核酸酶降解。
7.DNA连接酶(DNA ligase):是专门催化双链DNA中缺口共价连接的酶,不能催化两条游离的单链DNA链间形成磷酸二酯键。反应需要能量。
8.引物酶及引发体(primase & primosome):以DNA为模板,以核糖核苷酸为底物,在DNA合成中,催化形成RNA引物的酶称为引物酶及引物体。大肠杆菌的引物酶单独没有活性,只有与其它蛋白质结合在一起,形成一个复合体,即引发体才有生物活性。
9.复制叉(replication fork):复制中的DNA分子,末复制的部分是亲代双螺旋,而复制好的部分是分开的,由两个子代双螺旋组成,复制正在进行的部分呈丫状叫做复制叉。
10.复制眼θ结构:在一段DNA上,正在复制的部分形成眼状结构。复制眼在环状DNA上形成的结构与希腊字母θ相象,所以叫θ结构。
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11.前导链(1eading strand):在DNA复制过程中,以亲代链(3’→ 5’为模板时,子代链的合成 (5’→ 3’)是连续的.这条能连续合成的链称前导链。 12.冈崎片段(Okazaki fragment)、后随链(1agging strand):在DNA复制过程中,以亲代链(5’→ 3’)为模板时,子代链的合成不能以3’→ 5’方向进行,而是按5’→ 3’方向合成出许多小片段,因为是冈崎等人研究发现,因此称冈崎片段。由许多冈崎片段连接而成的子代链称为后随链。
13.半不连续复制(Semidiscontinuous replication):在DNA复制过程中,一条链的合成是连续的,另一条链的合成是不连续的,所以叫做半不连续复制。
14.逆转录(reverse transcription):以RNA为模板合成DNA的过程。
15.逆转录酶(reverse transeriptase):催化以RNA为模板合成DNA的逆转录过程的酶。 Temin(1960)首次从劳氏肉瘤病毒中发现。逆转录酶具有多种酶活性:依赖RNA的DNA聚合酶活性;依赖DNA的DNA聚合酶活性,RNA水解酶活性,DNA合成方向5’→ 3’。合成时需要引物与模板。
16.突变(mutation):基因组DNA顺序上的任何一种改变都叫做突变。分点突变和结构畸变。
17.点突变(Point mutation):是指一个或几个碱基对被置换(replacement),这种置换又分两种形式:转换(transition)一--指用一个嘌呤碱置换另一个嘌呤碱,一个嘧啶碱置换另一个嘧啶碱;颠换(transversion)一--指用嘌呤碱置换嘧啶碱或用嘧啶碱置换嘌呤碱。
18.结构畸变:基因中的缺口、或插入(insertion)或缺失(deletion)某些碱基造成移码突变使 DNA的模板链失去功能。
19.诱变剂(mutagen):使基因组发生突变的物理、化学、生物因素叫诱变剂。
20.修复(repair):除去DNA上的损伤,恢复DNA的正常结构和功能是生物机体的一种保护功能。
21.光裂合酶修复(又称光复活)(photoreactivation):可见光将光裂合酶激活,它分解DNA上由紫外线照射而形成的嘧啶二聚体,使它们恢复成两个单独的嘧啶碱。
22.切除修复(excision repair):在一系列酶的作用下,将DNA分子中受损伤部分切除,以互补链为模板,合成出空缺的部分,使DNA恢复正常结构的过程。
23.重组修复(recombination repair):DNA在有损伤的情况下也可以复制,复制时子代链跃过损伤部位并留下缺口,通过分子间重组,从完整的另一条母链上将相应的核苷酸序列片段移至子链缺口处,然后用再合成的多核苷酸的序列补上母链的空缺,此过程称重组修复。
24.诱导修复和应急反应(induction repair and SOS response)(SOS修复):由于DNA受到损伤或复制系统受到抑制所诱导引起的一系列复杂的应急效应,称为应急反应。SOS反应主要包括两个方面:DNA损伤修复(SOS修复或称诱导修复)和诱变效应。SOS修复是一种易出差错的修复过程,虽能修复DNA的损伤而避免死亡。但却带来高的变异率。
25.DNA重组(recombination):DNA重组是指在真核生物减数分裂过程中,细菌细胞的转化中、病毒转导中等发生的DNA片段的交换或插入。
26.基因工程(又称基因重组技术)(gene/genetic engineering):是将外源基因经过剪切加工,再插入到一个具有自我复制能力的载体DNA中,将新组合的DNA转移到一个寄主细胞中,外源基因就可以随着寄主细胞的分裂进行繁殖,寄主细胞也借此获得外源基因所携带的新特性。
27.转录(transcription):由依赖于DNA的RNA聚合酶催化,以DNA的一条链的一定区段为模板,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链互补的RNA链的过程。
28.模板链(template strand)[又称负(-)链,反意义链(antisense strand)]:转录过程中用作模板的这条DNA链,称模板链。 29.非模板链(nontemplate strand)[又称正(+)链,编码链(coding strand),有意义链(sense strand)]:与模板链互补的那条DNA链,称非模板链。
30.不对称转录(asymmetric transcription):因为RNA的转录只在DNA的任一条链上进行,所以把RNA的合成叫做不对称转录。
31.启动子(promoter):DNA链上能指示RNA转录起始的DNA序列称启动子。 32.转录单位(transcription unit):RNA的转录只在DNA的一个片段上进行,这段DNA序列叫转录单位。 33.内含子(intron):真核生物基因中,不为蛋白质编码的、在mRNA加工过程中消失的DNA序列,称内含子。
34.外显子(exon):真核生物基因中,在mRNA上出现并代表蛋白质的DNA序列,叫外显子。
35.转录加工(post-transcriptional processing):细菌中很多RNA分子和几乎全部真核生物的RNA在合成后都需要不同程度的加工,才能形成成熟的RNA分子,这个过程叫转录后加工。
36.核内不均一RNA(hnRNA):是真核生物细胞核内的mRNA前体分子,分子量较大,并且不均一,含有许
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多内含子。 37.RNA的复制(RNA replication):某些病毒RNA既可以做为模板合成病毒蛋白质又可在 RNA复制酶(RNA replicase)的催化下,以自身RNA为模板,合成互补的RNA新链,合成方向5'→3’,这一过程叫RNA复制。
(二)问答题
1.试述Meselson和Stahl关于DNA半保留复制的证明实验。
提示:①将E.coli放入以15NH4Cl为唯一氮源的培养基中连续培养十几代,使所有DNA分子标记上15N;②将15N标记的E.coli再放入普通的14N培养基中培养,在细胞生长一代、二代 、… 、n代的时间间隔内采样;③采用氯化铯密度梯度离心分离DNA,并用紫外照相技术检测DNA所在位置;④结果如下:其结果确切地证明DNA以半保留方式复制。
2.描述大肠杆菌DNA聚合酶I在DNA生物合成过程中的作用。 E.coli DNA聚合酶I是多功能酶,具有:①DNA聚合酶活性,能按模板要求,以5’→ 3’方向合成DNA,在DNA复制中,常用以填补引物切除后留下的空隙;②5'→3’外切酶活性,DNA复制后期,用于切除RNA引物;③3'→5’外切酶活性,用以校对复制的正确性,当出现错配碱基时,切除错配碱基直到正确配对为止;DNA聚合酶I不是DNA复制和校正中的主要聚合酶,它的功能主要是修复。 3.试述DNA复制过程,总结DNA复制的基本规律。
以E.coli为例,DNA复制过程分三个阶段;①起始:从DNA上控制复制起始的序列即起始点开始复制,形成复制叉,复制方向多为双向,也可以是单向,若以双向进行复制,两个方向的复制速度不一定相同。由于DNA聚合酶不能从无到有合成新链,所以DNA复制需要有含3’-OH的引物,引物由含有引物酶的引发体合成一段含3一10个核苷酸的RNA片段;②延长:DNA复制时,分别以两条亲代DNA链为模板,当复制叉沿DNA移动时,以亲代3’→5’链为模板时,子链的合成方向是5'→3',可连续进行,以亲代5’→3’链为模板时,子链不能以3’→5’方向合成,而是先合成出许多5’→3’方向的冈崎片段,然后连接起来形成一条子链;③终止:当一个冈崎片段的3'-OH与前一个冈崎片段的5’-磷酸接近时,复制停止,由DNA聚合酶I切除引物,填补空隙,连接酶连接相邻的DNA片段。
DNA复制时,由DNA解旋酶(又称解链酶)通过水解ATP获得能量来解开DNA双链,并沿复制叉方向移动,所产生的单链很快被单链结合蛋白所覆盖,防止DNA的变性并保护其单链不被降解,复制叉前进过程中,双螺旋产生的应力在拓扑异构酶的作用下得到调整。
DNA复制基本规律:①复制过程为半保留方式;②原核生物单点起始,真核生物多点起始,复制方向多为双向,也有单向;③复制方式呈多样性,(直线型、Q型、滚动环型…等);④新链合成需要引物,引物RNA长度—般为几个~10个核苷酸,新链合成方向5’→ 3’,与模板链反向,碱基互补;⑤复制为半不连续的,以解决复制过程中,两条不同极性的链同时延伸问题,即…—条链可按5’→ 3’方向连续合成称为前导链,另一条链先按5’→ 3’方向合成许多不连续的冈崎片段(原核生物一般长1000-2000个核苷酸,真核生物一般长100--200个核苷酸),再通过连接酶连接成完整链,称后随链,且前导链与后随链合成速度不完全—致,前者快,后者慢;⑥复制终止时,需切除前导链、冈崎片段的全部引物,填补空缺,连接成完整DNA链;⑦修复和校正DNA复制过程出现的损伤和错误,以确保DNA复制的精确性。
4.什么是逆转录?病毒中的单链RNA如何利用逆转录酶合成双链DNA,并整合到寄主细胞的基因组中? 提示:见名词解释“逆转录”。病毒的单链RNA在病毒进入寄主细胞后被释放出来,此 RNA带有与模板互补的tRNA引物,病毒的逆转录酶以此RNA为模板,从引物的3’-OH端,按碱基互补原则以5’→ 3’方向合成DNA链(-),形成RNA—DNA杂交分子,然后逆转酶发挥 RNA水解酶活性,水解杂交分子中的RNA链,最后以新合成的DNA链(-)为模板,合成另一条 DNA链(+),形成双链DNA分子(为病毒)整合到寄主基因组中,随寄主细胞的转录,产生病毒 RNA(+),此RNA可翻译病毒蛋白质,可作为后代病毒RNA。 5.DNA的损伤原因是什么?
提示:①自身复制过程中发生的错误:②外界环境的影响,如物理因素(紫外线、X一射线辐射等),化学因素(各种诱变剂、抗菌素等)。造成嘧啶碱基形成聚合体,发生碱基错配、缺失和插入。 6.简述基因工程的基本操作步骤及其应用意义。
提示:①获取外源目的基因;②寻找基因载体(通常为质粒、噬菌体等)使用限制性内切酶,使目的基因与载体产生相同粘性末端,两个末端互补连接,形成重组DNA;③通过转化(或感染)将重组DNA引入寄主细胞;④从大量的寄主细胞中筛选出带有重组体的细胞进行克隆。
意义:①利用基因工程技术,可以大量生产在一些正常细胞中产量很低的多肽物质,用于医药等工业生产中;②定向改造生物墓因结构,生产抗病强、品质优的各种农副产品,以提高经济价值;③用于生命科
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