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兰大量子力学计算操作步骤

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High Performance Computing Platform of CSU

中南大学高性能计算平台用户经验交流

Gaussian 计算实例

何永辉(hee_csu@126.com),Mar., 2010

作者简介:何永辉,中南大学化学化工学院 2007 级博士研究生,师从向娟、周 飞艨教授,主要研究方向为重大疾病致病机理的研究等。

计算优化乙烯结构:

假设计算机上已经安装好了 Gaussian03 和 GaussView3.07 这两个软件, 第一步,写好高斯输入文件:

1、开始运行 GaussView3.07,点击 File、New、Create MolGroup,打开一个新的窗口,如下 图:

2、点击按钮 Carbon Trigvalent(S-S-D),打开元素页面,

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3、点击碳碳双键按钮,在下面蓝色窗口中点两下,建立一个乙烯分子。

4、点击菜单上的 Calculate,选中 Gaussian..,打开高斯计算设置窗口。

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5、设定工作类别 optimization,

6、设定计算方法,Ground State 表示计算基态,DFT…表示用密度泛函理论,Unrestricted 表示用非限制性的,即分别计算α电子和β电子;B3LYP 表示用的函数为 B3LYP 函数。下 一行为计算所用基组设置,本计算采用的基组为 6-31G,后面的是加极化函数和弥散函数,我们 这儿暂时不考虑。然后再一下行第一个 Charge 表示计算分子所带电荷量,这里设为 0,表示是 中性分子;然后是自旋多重度 spin,singlet 表示自旋多重度为 1,分子中没有单电子。

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7、设置作业标题,手写输入 ethylene opt。

8、设置所需资源,%chk=ethylene.chk 表示计算结果生成的 chk 文件命名为 ethylene.chk, %mem=6MW 表示计算所需内存为 6M,%nproc=1 表示所需 cpu 数目为 1。

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HighPerformanceComputingPlatformofCSU中南大学高性能计算平台用户经验交流Gaussian计算实例何永辉(hee_csu@126.com),Mar.,2010作者
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