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DNA 序列的分类

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DNA 序列的分类

韩轶平;余杭;刘威;杨启帆

【期刊名称】《数学的实践与认识》 【年(卷),期】2001(031)001

【摘要】This paper proposes several methods for the classification of DNA sequences. We noticed that different sequences have different alkali radicals and therefore set up models using Euclidean distance, Mahalanobis distance and Fisher principle. We also noticed that different sequences have different permutations of alkali radicals and an algorithm using relativity analysis is proposed. Further we discussed a relativity analysis algorithm with feed-back mechanism. As to the natural and artificial data given our algorithms work well and fine results are given. At last several other common algorithms are compared, especially on their stabilities.%本文对A题中给出的DNA序列分类问题进行了讨论. 从“不同序列中碱基含量不同”入手建立了欧氏距离判别模型,马氏距离判别模型以及Fisher准则判定模型;又从“不同序列中碱基位置不同”入手建立了利用序列相关知识的相关度分类判别算法,并进一步研究了带反馈的相关度分类判别算法. 对于题中所给的待分类的人工序列和自然序列,本文都一一作了分类. 接着,本文又对其它各种常见的分类算法进行了讨论,并着重从分类算法的稳定性上对几种方法作了比较. 【总页数】8页(38-45) 【关键词】

【作者】韩轶平;余杭;刘威;杨启帆

【作者单位】浙江大学,;浙江大学,;浙江大学,;浙江大学, 【正文语种】中文 【中图分类】01 【文献来源】

https://www.zhangqiaokeyan.com/academic-journal-cn_mathematics-practice-theory_thesis/0201271991766.html 【相关文献】

1.分枝杆菌特殊DNA序列检测及其在分类鉴定中的应用进展 [J], 刘佳文; 庄玉辉

2.引力原理聚类算法解决DNA序列分类 [J], 宗鹏安; 陈华; 管乐乐; 黄星星 3.聚类分析方法在DNA序列分类中的应用 [J], 王显金; 阳军 4.DNA序列分类模型 [J], 刘忠敏; 章向明; 王涛; 陈帮富 5.DNA序列分类的Fisher判别法 [J], 周玉元; 周铁军

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DNA 序列的分类

DNA序列的分类韩轶平;余杭;刘威;杨启帆【期刊名称】《数学的实践与认识》【年(卷),期】2001(031)001【摘要】ThispaperproposesseveralmethodsfortheclassificationofDNAsequences.Wenoticedthatdifferent
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