一:名词解释
1. 生物信息学 2. NCBI 3. PubMed 4. 生物芯片 5. BLAST 6. UniProt 7. 电子克隆 8. EMBL
二:填空题
1. 基因芯片可以分为
2. 人类基因组全序列分析分两大步骤即制图和测序,并最终绘制出四张
图谱:
3. 分子系统发生分析主要分为三个步骤即 4. 国际上最主要的三大核酸序列数据库分别是 5. 蛋白质得分矩阵有
7. 文献是掌握科研进展的最直接方式,目前由NCBI维护的大型文献资源是 。
3. 用于核酸序列比对中常见的三种得分矩阵,分别为
4. 根据生物芯片探针分子类型的不同,可以将生物芯片哪三种, 5. 核酸序列分析所获得的信息主要有(举例说明四个)
6. 限制性酶切分析是分子生物学实验中的日常工作之一,这方面最好的
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限制酶数据库是
三:选择题
1、如果试图确定一个新蛋白质序列属于哪一个蛋白质家族,或该序列可能包含何种结构域或功能位点,应使用:( ) A: PROSITE数据库 B: DDBJ数据库 C: PIR数据库 D: PDB数据库 2、构建序列进化树的一般步骤不包括:( )
A:建立DNA文库 B:建立数据模型 C:建立取代模型 D:建立进化树 3、BLAST教案所程序中,哪个方法是不存在的?( ) A:BLASTP B:BLASTN C:BLASTX D:BLASTQ
4. 以下常见的几个物种,哪一个目前还没有完成全基因组测序: ( ) A: 茶树 B: 玉米 C: 水稻 D: 小鼠
5、向核酸序列数据库(GenBank/EMBL/DDBJ)提交数据,应该使用下面
哪个软件:( )。
A: Blast B:Sequin C:SRS D:Swiss-Model 6、在蛋白质序列数据库中比较查询手头未知的蛋白质序列,应使用Blast中哪个具体的算法:( )。
A:BLASTX B:tBLASTN C:BLASTP D:BLASTN 7、下列中属于一级蛋白质结构数据库的是:( ) A: EMBL B: DDBJ C: PDB D:SWISS-PROT 8、下面不属于SWISS-PROT蛋白质数据库的注释范畴的是:( ) A: 与其它蛋白质的相似性 B: 蛋白质的二级结构 C: 由于缺乏该蛋白质而引起的疾病 D: 核酸的功能描述 9、下列属于蛋白质二级结构预测的软件程序是( ) A: BLASTX B:SOPMA C:DNAstar D:GO
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10. 如果做DNA结构分析,应该考虑用下面哪个数据库:( ) A:GenBank B: PIR C:NDB D:UniProt
四:简单题
1.简述Entrez的设计概念和使用方法?
2. 简述生物大分子PDB存储的生物分子种类和数据结构特点? 3.简述生物信息学的研究意义?
4 简述蛋白质序列分析的基本内容以及常用的软件? 5. 简述Swiss-Prot的数据结构? 6、 简述序列多重比对的意义? 7、简述生物信息学的发展历史?
五:论述题
1. 论述蛋白质相互作用研究的意义,传统的实验方法和计算预测方法的应用?
2. 论述后基因组时代生物信息学面临的挑战和研究策略? 3.论述生物信息学的应用? 4. 论述如何利用基因芯片数据做聚类分析
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